没用过这个juicer.sh,安装使用很麻烦 我们这里有组装挂载的视频,你可以看看:https://bdtcd.xet.tech/s/2TnPfm
回答于 2023-10-13 10:11
不建议用NCBI上的参考基因组,GFF格式不标准导致脚本报错;
回答于 2023-10-13 10:09
数据量够的话,可以不用处理,污染的序列比对不上参考基因组,对结果影响不大; 主要是污染数据,数据量相对减少了;如果比对之后平均深度能达到分析要求就可以了
回答于 2023-10-11 11:31
你观察数据就知道了,SNP用VCF文件记录,你看看这个,写个perl脚本自己过滤一下就行: https://www.omicsclass.com/article/847
回答于 2023-10-11 11:28
你是用的我们提供的docker镜像吗?在镜像里面分析数据我们都经过测试没问题的; 如果没有使用我们的镜像,是你你自己安装的R包有问题,需要更新这个脚本需要的R包到最新:enrichKEGG_pip.R
回答于 2023-10-11 11:13