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请问老师，用比对后的bam文件进行call snp，bam文件中储存了比对...
不用过滤，污染的reads不会比对到参考基因组，不会影响用于call SNP，也就不会影响call SNP的结果；
回答于 2023-10-09 20:42
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比较基因组学鉴定出的两个物种的基因家族的基因存在共线性,如何...
我们有课程，你可以看课程，里面详细介绍了同源基因的kaks计算：https://bdtcd.xet.tech/s/24yiRs
回答于 2023-10-09 16:14
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QTL-seq阈值线0.99，0.95那个R语言源代码的输入参数是啥，能给个...
我们有BSA视频课程，里面有脚本自动计算阈值线0.99，0.95：https://bdtcd.xet.tech/s/1w3axx
回答于 2023-10-08 13:01
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annovar报错问题
有些参考基因组里面有一些 ambiguous 碱基 ，ANNOVAR处理不了，这是作者的回答：https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/misc/faq/ 解决办法就是将 ambiguous 碱基根据IUPAC ：（https://www.omicsclass.com/article/409 ）编码替换成一单个碱基；
回答于 2023-10-07 10:05
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PopLDdecay总是显示command option error
注意空格，linux用空格区分命令的不同部分： 不要取带有空格的文件夹或者文件名字，不然会给自己带来麻烦
回答于 2023-09-28 07:38