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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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物种注释 16S 出现killed

数据量大,需要电脑内存足够才行,不然系统会自动杀死:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-09-02 09:19

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老师好,请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的...

最后一列是基因DNA上的突变; 第一列是 突变引起基因上的氨基酸改变, 课程里面哟详细讲解,你看看视频课程的;https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ

回答于 2024-08-30 15:09

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是没有gene-family了嘛

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回答于 2024-08-30 11:50

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gwas根据阈值筛选关联的SNP,并生成bed文件,排序时无法生成标准...

pvalue.txt 文件列的空白不是tab键,你检查一下,生成这个文件的命令是否错误。 看列分隔符可以用以下命令: cat -A pvalue.txt|head

回答于 2024-08-22 17:05

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老师好,请问应该怎么下载/处理原始数据才能在single-cell:v3.0...

你这个数据已经跑完了cellranger,不需要跑cellranger了;表达矩阵已经出来了,就是这三个文件; 把每个样本的三个文件分别放到不同的文件夹,直接读入数据即可:参考这个:https://www.omicsclass.com/article/2498 更多例子:https://www.omicsclass.com/article/2482

回答于 2024-08-22 16:39

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perl语言命令行参数设置

这里有例子你看看的:https://www.omicsclass.com/article/341

回答于 2024-08-21 16:58

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SeparateChromosomes2划分连锁群不合理怎么解决

你这个不是染色体,是contig,这些短的contig组装不可靠可以删除一下;

回答于 2024-08-19 11:53

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老师好,我在利用在SNP设计dcasp标记时得到的primers.result.xls...

看报错信息,可能输入文件格式有问题吧,建议对比例子的输入文件格式准备文件;建议 截图说明一下,输入输出文件还有命令行都截图,才能更能好的给解决问题

回答于 2024-08-19 09:27

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老师 就是Rhododendron_delavayi 和Rhododendron_irroratum这两...

检查 基因组文件和对应的GFF3文件格式是否有异常,格式不标准导致报错; GFF里面染色体ID和基因组的染色体ID保持一致才行;

回答于 2024-08-14 13:17

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GWAS计算表型数据blup时一直出错

输入文件格式不对,和例子对比一下。多年多点的数据才可以计算BLUP值,你这个计算不了; 不要上传文件,把文件打开截图看看的;

回答于 2024-08-08 12:44