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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3849 个回答

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基因组功能注释uniprot报错

我们已经重新建立数据库,上传了文件,你重新下载数据即可

回答于 2023-09-22 15:34

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当我用在比较基因组学分析做数据准备时用组学提供的代码进行基因...

从GFF文件里面搜索一下,这些基因ID看看这些基因是不是有异常,没问题忽略就行;

回答于 2023-09-21 20:23

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绘制circos图时没有内部连线

这里是数据之间染色体ID要一致:

回答于 2023-09-21 18:26

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Tassel做GWAS分析时混合线性模型报错,有老师知道是什么原因吗?

看看有么有输出,没有输出可能是输入文件格式问题,或者电脑内存不够:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 18:24

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基因组重测序,排序完后进行去重复总是被Killed

数据量大,需要电脑内存足够才行,不然系统会自动杀死:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 18:23

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老师,您好,我在原版的XPCLR分析时得到最后的XPCLR_score,但是...

我们群体遗传进化里面有讲解,你自己设置相同的窗口大小和步长即可:

回答于 2023-09-21 10:03

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genome-annotation缺失tantan

我们的代码和镜像都是经过测试的;按照课程练习使用一般不会由于软件安装问题报错; 你这个可能是命令使用错误导致;

回答于 2023-09-21 07:23

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注释脚本

基因组注释脚本在课程里面需要购买:https://bdtcd.xet.tech/s/2TnPfm

回答于 2023-09-21 07:21

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在gwas分析中,单一线性模型没有问题,混合线性模型运行到30%就...

看看有没有结果,有结果就没事; 如果没结果,可能是电脑内存不够:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 07:19

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同一物种批量注释基因组

这个有些步骤可以简化的,比如 重复序列,有了repeat库,直接用这个库repeatmask注释就行;  基因注释可以用注释好的基因作为参考,

回答于 2023-09-20 20:25