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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3849 个回答

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mcmctree能否多线程运行?

不能多线程,只有单线程; 如果太慢建议用BV方法:

回答于 2023-09-20 10:35

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水稻F2群体株高性状的GWAS分析模型选择GLM还是MLM

如果没有群体结构的话优先选择GLM; 也可以尝试MLM 具体可以看课程:https://bdtcd.xet.tech/s/2KgXQq 模型没有好坏,最适合自己数据的模型就是好模型; 各种关联模型都可以试一下,哪个关联的结果好选用哪个

回答于 2023-09-20 10:35

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老师好,我在运行比较基因组学11.time_tree_BV脚本的时候,报错E...

对的,你再检查化石时间设置的

回答于 2023-09-18 12:07

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quickmerge合并多个软件组装的基因组后,使用nextpolish去polish...

这个长度合并前后变化还没有关注过,变少了有可能哪里有问题, 你再检查检查数据的;看看合并之前两个组装结果的序列长度,然后再看看合并后的序列长度;

回答于 2023-09-18 08:10

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安装docker 进行16S分析物种注释过程很慢

这个classifier需要内存很大,内存不够可能导致系统kill 内存和存储硬盘不是一个东西,你百度搜索一下补充知识; windows docker内存设置:https://www.omicsclass.com/article/1413 组学大讲堂云服务器即买即用,避免安装软件的麻烦和内存限制: https://study.omicsclass.com/ 

回答于 2023-09-18 08:06

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老师好,我想问一下自己找公司测序得到的GB文件和fasta的文件跟N...

这个你看看需要自己做矫正,或者哪里有问题让公司做; 自己做矫正我们这里有叶绿体课程你看看的:https://bdtcd.xet.tech/s/2h9NgP

回答于 2023-09-18 08:04

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比较基因组学分歧时间脚本

输入文件有错误,你再看看视频课程的;

回答于 2023-09-17 10:19

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老师好,我在跟着课程实操时,运行gatk call snp时候,使用源代...

你的命令行写错了,看不到你的命令行,你自己检查检查的; 脚本前面有些变量需要设置,你记得运行设置;

回答于 2023-09-17 10:18

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GWAS分析中的PCA绘图识别不出来R脚本

请使用我们的docker镜像,如果自己配置环境,需要把R脚本第一行的Rscript 路径相应修改一下;

回答于 2023-09-17 10:17

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请教老师,Gemma分析时的报错问题?

输入文件不存在吧,你检查输入文件的

回答于 2023-09-16 07:46