使用经过过滤的cleanvcf文件,SNP和indel都可以做gwas,indel做GWAS需要单独格式转换,因此我们一般去除INDEL只用SNP做GWAS分析;
回答于 2023-09-10 08:41
这个文件是镜像里面的,你学习课程在对应的docker镜像里面,也可以到官方下载:这里有官方网站可以下载:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/
回答于 2023-09-09 10:08
RNA中:UAG:琥珀密码子(amber codon)UAA:赭石密码子(ochre codon)UGA:蛋白石密码子(opal codon)DNA中:TAG:琥珀密码子TAA:赭石密码子TGA:蛋白石密码子 UAG与UGA在某些情况下也可以编码氨基酸。2007年,有研究发现UGA密码子许多硒蛋白的信使RNA中有硒半胱氨酸插入序列的存在,可以使与该序列相邻的UGA密码子编...
回答于 2023-09-09 09:41
你说的是PCR和转录组测序的基因表达量之间的差异吗? 这个是有可能的,基因的表达是有时空特异性的,首先你的两次做的样本是否一致;不一致会有差异的;
回答于 2023-09-08 09:46