omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好，我用单细胞课程的脚本做轨迹分析，一直报错是怎么回事...

输入文件格式有问题吧，你再对比一下示例文件

回答于 2023-09-06 09:23

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你这个是文件夹，不是压缩包文件，重新下载课程参考资料吧

回答于 2023-09-06 09:22

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检查 4个输入文件格式有么有异常吧，bed cds文件，ID是否对应等

回答于 2023-09-06 09:21

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基因组注释，建议用docker吧，里面有些软件不支持 singularity

回答于 2023-09-04 09:31

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ks>1 是有可能的，概念是这么定义的： Ka和Ks的计算公式： Ka=发生非同义替换的SNP数或者非同义替换位点数 Ks=发生同义替换的SNP数或者同义替换位点数但是会会考虑不同碱基之间替换发生概率不同，会用到不同的替换模型，因此不是简单的根据概念计算的；

回答于 2023-09-04 09:26

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文件路径问题，你重新刷新一下，再打开

回答于 2023-09-04 09:18

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这几个基因结构有问题吧，你看看的结果，不行就手动删除吧

回答于 2023-09-04 09:18

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没有富集到结果，你输入的基因ID不能找到对应数据库里面的ID；

回答于 2023-09-04 09:16

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基因位置文件中，染色体ID不在参考基因组fasta序列中；检查一下自己的数据

回答于 2023-09-04 09:15

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拟南芥bed文件打开看看这个基因是不是有问题

回答于 2023-09-04 09:12