现在 我们不用biolinux了,用docker:https://www.omicsclass.com/article/1198
回答于 2023-08-31 15:20
基因组序列ID和GFF文件可能不匹配,你看看这个序列ID在两个输入文件里面是否都能搜索到
回答于 2023-08-30 17:54
WARN 警告一般忽略就行, 这个时间和你的电脑性能还有数据量有关,你耐心等待吧,几分钟,几小时,十几个小时都有可能;
回答于 2023-08-29 22:12
过滤条件不一样得到的vcf文件不一样,自己选择好过滤条件,用那个vcf都行; Plot_OnePop.pl 会自动对结果取bin平滑曲线生成:*.bin.gz 文件,你也可以查看他的帮助,自己设置bin Usage: Plot_OnePop.pl -inFile LDdecay.stat.gz -output OUTOptions-inFile <s> : Input PopLDDecay OutPut Stat File-in...
回答于 2023-08-29 09:41
看看这个,不行的话就不用mysql了,用sqlilte: https://www.omicsclass.com/article/2019
回答于 2023-08-28 15:54
基因家族分析作为低投入高产出的发文思路,受到广泛关注,分析的人也越来越多,我们也对基因家族分析课程针对之前学员经常遇到的问题进行了更新: 解决基因ID不对应的问题例如上面的玉米基因组,序列中的蛋白ID与GFF中的m RNA ID不对应导致出错,我们使用AGAT自动提取基因组中的cds,可以使GFF与蛋白ID保持一致,为后续的...
回答于 2023-08-28 10:00
基因家族分析作为低投入高产出的发文思路,受到广泛关注,分析的人也越来越多,我们也对基因家族分析课程针对之前学员经常遇到的问题进行了更新: 解决基因ID不对应的问题例如上面的玉米基因组,序列中的蛋白ID与GFF中的m RNA ID不对应导致出错,我们使用AGAT自动提取基因组中的cds,可以使GFF与蛋白ID保持一致,为后续的...
回答于 2023-08-28 09:59