omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，因为样本过多（...

你这个信息截图不全，没发现有什么异常的报错；最后的信息也是warn警告信息，不影响结果的；看一下服务器内存是多少，内存不够运行样本太多也会报错； free -h #查看内存

回答于 2024-10-21 18:13

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看看服务器内存多少，内存不够也可能出现这个问题： free -h #查看内存

回答于 2024-10-21 18:07

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看GC分布图没问题，前面几个碱基抖动正常的；

回答于 2024-10-21 18:05

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购买了我们课程请使用docker镜像分析；镜像里面安装了课程里面的软件；

回答于 2024-10-21 16:53

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是的，你的是什么物种就下载对应的物种基因组；然后建立索引

回答于 2024-10-21 09:21

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生成的文件已经存在，你重新运行删除一下这个文件

回答于 2024-10-21 09:20

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这里有例子你看看的：https://www.omicsclass.com/article/2483 更多例子：https://www.omicsclass.com/article/2482

回答于 2024-10-17 17:40

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Rstudio server 报错可能原因，重启服务器之后 #selinux设置 #setenforce 0

回答于 2024-10-16 12:42

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文件比较小没有生成吧，如果你运行代码没有报错或者中断正常运行出来的就没问题；你继续运行代码即可；

回答于 2024-10-16 09:21

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docker hub 国内登不上的原因；如果购买了我们组学大讲堂课程可以联系客服给本地镜像文件：：点击联系客服

回答于 2024-10-14 09:33