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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3849 个回答

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老师您好,请问使用fastp后没有得到每个样本对应的html文件,只...

命令行的输出文件是不是都重名了,你检查你每个样本的fastp命令行;

回答于 2024-07-16 10:44

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我的分析内容是16s分析肠道菌群,我是按照咱们课程里的步骤进行...

把这个文件env.sh cat 出来截图看一下,帮你检查错误; 看你这个报错可能是windows编码和linux编码不同导致报错,建议用专业的文本编辑工具编辑代码脚本等;并把编码格式统一成UTF-8格式;https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2024-07-15 15:53

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老师,我在提环基因序列cds以及pep时出现了插件报错的情况,检查...

不同的物种,下载的基因组GFF文件格式不标准会导致程序报错,建议你针对具体物种单独提问,

回答于 2024-07-15 15:50

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老师,我的结构域搜出来全都是这种不显示我的家族GASA这种字母的...

你再了解一下自己研究的这个家族结构域的特点吧,读读文献

回答于 2024-07-15 15:48

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VCFtools计算fst, pi, ROD, tajimaD, xpclr计算xpclr,得到这些...

目前这个平滑的脚本没有添加阈值线这个功能。

回答于 2024-07-15 15:47

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使用promo网站分析动物顺式作用元件遇到问题

这个事植物的网站,动物的使用可能会有问题,不建议动物的使用;

回答于 2024-07-15 15:44

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老师,我想问一下,第一列的1234这种数字代表的是啥呀?我能不能...

GFF文件吗?第一列是染色体ID,不是随便加的,要根据物种基因组染色体编号

回答于 2024-07-15 15:44

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执行### 物种注释 16S/18S #全长作为分类数据库 ### 反复跳出do...

电脑内存不够自动杀死任务了,你看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1413 长时间运行的任务,建议电脑不要关机;使用以下命令后台执行命令: nohup sh qiime2.sh > qiime2.sh.o &

回答于 2024-07-15 15:42

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进入容器以后是这个样子,怎么办

ctrl+c 终止容器里面的任务,试试的

回答于 2024-07-15 15:41

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summarize_taxa.py缺少脚本

这个脚本时qiime1的脚本,安装在我们提供的docker镜像中,你在docker容器里面可以直接使用; 不然你需要自行安装qiime1到你的电脑中;

回答于 2024-07-11 18:31