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LTR_retriever结果问题

solo-LTR  这个分析没有,需要自己手动筛选才行;

回答于 2023-08-11 17:07

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docker怎么设置镜像以及内存,最后一张图是基因家族分析课程里面...

docker 内存设置方法:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-08-11 08:44

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叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed,程序终止。

内存不够超了,系统自动杀死任务了,你启动docker容器的时候内存多设置一些:比如  -m  50G 

回答于 2023-08-09 11:17

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hifiasm结果偏大怎么办,是什么原因呢

你这个相差太大,是不是基因组survery 做的有问题;多倍体建议用GenomeScope 2.0 评估,GenomeScope 1.0可能评估错误 在线评估网站:http://qb.cshl.edu/genomescope/genomescope2.0/

回答于 2023-08-09 09:10

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基因组注释:10.PASA_update,根据fa和gff文件生成pep或者cdna

输入文件路径不对,gff3文件和基因组fasta文件,路径不对, 你学习学习linux基础吧

回答于 2023-08-07 10:18

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老师,您好,RNAseq分析中,进行PCA分析时,为什么会有如下的报...

命令行用错了吧,你再看看例子的

回答于 2023-08-05 08:21

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比较基因组学NCBI数据提取CDS失败

看看哪里是不是 报错了: 这个几个sed可以不用做:

回答于 2023-08-02 13:39

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BSA分析中QTL-seq组学大讲堂给出的修改过的参考连接内容怎么跟原...

#    我们修改后的安装方法,手动安装 $ git clone https://github.com/omicsclass/QTL-seq.git $ cd QTL-seq $ pip install -e .

回答于 2023-08-02 09:47

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iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G -m MFP+ASC...

说你的序列有问题你检查看看的

回答于 2023-08-01 17:00

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基因家族MCScanX共线性分析中是否把串联复制和大片段复制都筛出...

这里只有大片段复制的基因对,串联重复的基因对不在这里

回答于 2023-07-31 06:05