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使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载...
可能那些长的contig 就是一条染色体吧，你看看其他长的contig是不是这样的；
回答于 2023-06-01 14:33
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关于动植物基因组组装课程中关于重复序列注释的问题
1. 我们的deep TE用的是自带的库预测分类，方法不一样； 2. 第99行和第204行的区别：运行RepeatMasker结果文件的不同第99行：生成的contig.fa.masked文件，其中的重复序列是用N表示 参数不一样，xsmall 表示小写ATCG为repeat soft mask第204行：同样生成contig,fa.masked，其中的重复序列用小写字母表示。两者不同，...
回答于 2023-05-28 15:45
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尊敬的老师，在按照咱们课程进行选择消除分析 fst pi ROD时，可...
-f 参数 是过滤短于这个参数的染色体，你的基因组染色体长度你看看的，有这么长吗？
回答于 2023-05-28 15:37
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尊敬的老师！！恳请您在百忙中帮忙解答！根据群体遗传进化课程我...
样本ID不能超过10个字符，你仔细检查一下，简化自己的样本ID； 如果超过10个字符会自动截断到10个字符，可能导致ID重复，你打开phy文件看看吧
回答于 2023-05-27 12:59
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MCScanX分析时 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致，不能获...
ID不一样，可以试试这里的代码解决一下：https://www.omicsclass.com/article/2032
回答于 2023-05-26 08:02
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在初次docker运行程序时发现问题
我们 的镜像是基于amd64/x86架构的CPU，苹果m系列cpu是arm64的会有兼容问题； 可以买我们的提供的云服务器分析数据：https://study.omicsclass.com/index
回答于 2023-05-26 07:57
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做基因家族分析时，用MCScan做共线性分析，跟着教程走没有发现有...
可以检查一下自己的分析步骤，所有的输入输出文件都看看有没有异常； 如果没有异常就是正常现象
回答于 2023-05-24 15:32