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genome-annotation的docker转singularity的容器后，rmblast使用...
可以试一下podman，一个docker替代工具 建议使用docker，或者购买我们组学大讲堂的服务器，里面安装了docker
回答于 2023-04-27 14:10
老师，您好！获取不了基因与mRNA的关系怎么办呢？下面是我物种的...
你的基因组gff文件格式不标准，缺失gene信息：https://www.omicsclass.com/article/816 https://www.omicsclass.com/article/2081
回答于 2023-04-27 09:06
关于基因组功能注释脚本（interproscan.sh -i interproscan.pep....
有些数据库不需要的话可以不用注释： 用这个参数指定： -appl CDD,COILS,Gene3D,HAMAP,MobiDBLite,PANTHER,Pfam,PIRSF,PRINTS,PROSITEPATTERNS,PROSITEPROFILES,SFLD,SMART,SUPERFAMILY,TIGRFAM 试试运行这个：13.func_uniprot_interproscan2.sh interproscan.sh -i interproscan.pep.fa \ -b interproscan.out -f "...
回答于 2023-04-27 06:57
老师，关于PASApipeline配置的问题
建议用我们的docker镜像，里面都设置好了。自己配置PASA可以参考PASA官方网站； 不同的服务器mysql安装环境不一样，我这边不好帮你查原因
回答于 2023-04-24 18:57
老师，您好，不能用GFF文件提取exon位置信息文件，结果文件是空...
看看这个试试的：https://www.omicsclass.com/article/2032
回答于 2023-04-23 07:47
利用ParaAT2.0生成计算KaKs所需要的AXT文件，但是AXT文件为空
参考这里：https://www.omicsclass.com/article/1939
回答于 2023-04-18 12:02
老师，群体进化分析中做进化树的时候，VCF转换成phy文件，输入命...
大量数据，内存不够吧，你多给些内存docker，xmx 参数也多设置： https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2023-04-12 09:22