回答问题 · 2024-10-27 08:26 找不到课程对应的代码文件
回答问题 · 2024-10-25 09:23 老师,我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入,但是在将gvcf转换成vcf时,发现在Lc2Ns染色体就结束完成了,这是正常现象嘛,是我使用的近源种参考基因组的原因嘛?我的是简化基因组测序的
发表了文章 · 2024-10-24 12:05 igraph 报错: libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory
回答问题 · 2024-10-22 14:06 成功得到了gvcf文件后,合并gvcf文件时,在导入db步骤中,由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围,因此我使用CSI建立索引后,发现导入db的代码依旧无法运行,需要idx格式的索引,怎么办
回答问题 · 2024-10-22 09:48 linux里不能通过 sudo docker pull omicsclass/samtools:latest,显示连接超时
回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师,我有141个样品,现在IndexFeatureFile,tabix,bcftools都无法成功构建gvcf的索引,只有CSI格式能成功索引,这个格式在后续也用不了,这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛,还是说我只能重新生成vcf文件了
回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh
回答问题 · 2024-10-21 18:13 老师 就是质控出来的好多个个体的这个部分Per base sequence content都出现以下这种情况 这种是不是不行啊
回答问题 · 2024-10-21 16:56 fasttree 建树时没有找到这个软件
回答问题 · 2024-10-21 09:45 Sripts插件缺失,之前下了scripts的文件,然后在本地跑代码的时候跑出来文件发现为0,后找对接老师拿了压缩包,导入后还是不对,后检查,发现还是少了这个插件