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发起提问 · 2020-12-30 10:01 请教老师,用自己的hmm文件,进行了domain的二次搜索,结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后,再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是,如果要这些部分的结果截取序列,做进
发起提问 · 2020-12-30 00:10 请教老师,用自己的hmm文件,进行了domain的二次搜索,结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后,再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是,如果要这些部分的结果截取序列,做进
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回答问题 · 2020-12-29 14:34 老师好,想请教一下,如果拟搜索的家族是一个超家族,序列长度较长,比如图,463bp。用hmmsearch后,hit到的结果里面的hmm coord from to 是存在好多的一部分的片段,比如310~460的部分片段,但是E值很小。请问这种hit结果如何
发起提问 · 2020-12-28 10:02 老师好,想请教一下,如果拟搜索的家族是一个超家族,序列长度较长,比如图,463bp。用hmmsearch后,hit到的结果里面的hmm coord from to 是存在好多的一部分的片段,比如310~460的部分片段,但是E值很小。请问这种hit结果如何
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