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多序列比对问题
导出方法可参考这两篇文章: https://www.omicsclass.com/article/724 https://www.omicsclass.com/article/734
回答于 2019-04-11 18:13
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老师，在做基因的顺势作用原件的过程中，最后形成两个配置文件，...
展示所有的顺势作用原件可能会比较多。最好挑选一些感兴趣的。运行如下命令可以挑选所有的顺势作用原件。 cat PlantCARE_9210__plantCARE/plantCARE_output_PlantCARE_9210.tab | awk -F"\t" 'BEGIN{OFS="\t"} {print $1,$4,$4+length($3),$2}'>feature.bed
回答于 2019-04-10 17:00
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老师，我用perl script/domain_xulie.pl去除冗余，最后生成文件...
看命名规律，你把蛋白ID里面的P统一搜索替换成T，这样就一致了；
回答于 2019-04-03 18:02
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请问老师，做基因组共线性的物种组装必须都是complete genome吗...
scaffold的也可以做，但是数量 一般都比较多，所以最后绘图的结果可能并不理想。
回答于 2019-04-03 17:58
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老师，我的gene-ID和mRNA-ID用mRNAid_to_geneid.pl提取不出来，...
网上找不到别的基因组了吗？最好不要用NCBI上的基因组分析
回答于 2019-04-03 17:37
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老师，您好，请问kaks_calculator只能一次性计算一对基因吗 能不...
kaks_calculator可以一次计算多对基因，其输入文件为axt格式，如下图所示。但是输入文件准备时需要一对一对的获取。
回答于 2019-04-03 17:23