安生水
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165 个回答

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ensemble下载的物种GFF文件没有染色体信息该怎么办

你遇到的问题应该是该基因组组装结果不好，只组到了scaffold水平。

回答于 2019-03-08 16:19

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我再ITOL上传了进化树文件，为什么总显示图片的结果，不知道是nw...

应该是你的nwk文件有问题，你检查一下。

回答于 2019-03-08 11:42

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老师；我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样；蛋白序列上显示gene...

你这gff文件是从NCBI下载的么，最好去别的网站下载

回答于 2019-03-08 09:04

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MCSCANX共线性图代码报错

路径错了，需要到/biosoft/MCScanX/MCScanX/downstream_analyses 目录下才能运行这条命令

回答于 2019-03-06 13:23

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请问我要分析的物种里gff文件没有染色体命名信息，该怎么办

NCBI下载的基因组会有这种情况，最好不要使用NCBI下载的，可以去其他网站查找一下

回答于 2019-03-06 10:53

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进化树

是你的序列差异太大了吧，无法构树一般都是因为这个

回答于 2019-03-06 09:15

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老师，通过蛋白保守相似序列分析，推测了葡萄园有孢汉逊酵母中与...

你可以再描述得清楚一些，看不太懂你的问题在哪。如果基因组有基因序列的话很好提取的。

回答于 2019-03-01 09:24

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老师好，我已经导入了虚拟光驱，但还是显示不行，重新弄了好几次...

是虚拟机还是什么啊，问题描述详细，最好配图说明

回答于 2019-02-28 09:17

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有关基因家族鉴定学习课程的问题：在利用hmmer软件鉴定基因家族...

这个不是固定的，看你要分析的基因家族的实际情况而定。

回答于 2019-02-28 09:15

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绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错...

ncbi数据库基因组基因ID与我们熟悉的不太一样，建议别用。

回答于 2019-02-24 18:39