一般和一致的motif 进行比较吧,已知的motif多数功能明确,预测到新的之后,和已知的相似 往往功能也相似,一般有可以用一下这个软件:http://meme-suite.org/tools/tomtom
回答于 2019-10-25 13:49
可以看看鉴定的motif和已知的motif是否一致相似之类的,可以试试 软件http://meme-suite.org/tools/tomtom
回答于 2019-10-25 13:47
你指的是hmmsearch结果筛选吧,linux命令就可以,基于awk 对特定列要求evalue大于指定值吧
回答于 2019-10-25 13:39
参考:https://www.omicsclass.com/article/264 https://www.omicsclass.com/article/325
回答于 2019-10-25 11:21
没有明确说负相关就一定关键基因下调表达,抽取几个去查一下相关文献,对应的基因在其他癌症中的表达变化情况
回答于 2019-10-21 14:37
参考这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/604
回答于 2019-10-18 13:56
确定JAVA成功的话,本身mapman软件安装过程没有什么特别的,检查是不是个别选项选错了,或者参考一下视频课程: https://www.omicsclass.com/course/26
回答于 2019-10-16 09:29