Daitoue
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一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这...

一般提供的都是基于这个能看出来,不过它没有显著性值,差异倍率对数值确实就是根据网站介绍的比值对数结果。

回答于 2019-07-10 09:13

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您好,我再用ftp上传数据到NCBI上出现了和您一样的问题,请问您...

确定地址密码啥的没有错吧

回答于 2019-07-09 14:17

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如何用荧光定量验证转录组结果

表达数据趋势一致的话,理论上,倍率应该相近的

回答于 2019-07-08 11:22

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请问一下这些处理的缩写都是什么意思?

先了解这些信息的来源,查找相关的文献或者网页介绍,直接这种缩写很难去解释   我看的话,大概是  地上部分,20天、18小时光照、6小时黑暗、大概什么胁迫处理值了的,多小时~~这种肯定是自己看文献才是准确的

回答于 2019-07-08 11:18

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老师,我想问一下课程里面有个课程是可以处理双通道芯片的,它是...

想具体了解双通道芯片,那你可以取GEO数据网站看看对应的数据介绍,网站会告诉你哪个是样本,另外,双通道芯片一般情况是一张芯片对应两个样本,课程进行介绍的只是原始数据标准化而已,标准化之后的结果一般是获取M值,也就是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据。 GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化

回答于 2019-07-08 11:14

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图一与图二的格式不同是否会影响使用?如果影响,如何用bio-linu...

二者格式是一样的,只不过一个序列多行一个单行,不影响使用

回答于 2019-07-08 10:19

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你好,我在MCScanX共线性分析过程中用get_gene_position.pl提取...

不太对指的是?我看这个是正常的文件内容啊

回答于 2019-07-08 10:18

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您好,我想问下如果我的基因家族有两个结构域,两个pfam号,我应...

两个pfam都搜索一次 取交集结果

回答于 2019-07-08 10:14

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老师您好,我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的serie...

下载数据之后,想知道数据是如何处理的可以选择进入单样本的GSM accesion对应的单样本界面,了解对应的数据处理方法

回答于 2019-07-05 15:13

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GEO双通道芯片数据

双通道芯片本身就是在设计的时候设置对照和处理,直接基于比值判断差异,一般不单独利用其中的每组数据进行分析,如果实在需要芯片中两组数据,可以用limma包转换一下,获得标准化的数据。 GEO芯片数据标准化

回答于 2019-07-04 09:33