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circos-基因组圈图绘制后，发现位置很近的基因没办法在图上都显...
参考文章修改参数，调整图片的大小 同时结合其他参数控制标签错开： https://www.omicsclass.com/article/678 https://www.omicsclass.com/article/677
回答于 2019-06-14 12:31
进化树构建模型的区别
这边也不同清楚具体的差别，推荐阅读一些关于这些模型的文献，这里列举一个关于进化树模型的文章：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19087270 其他的你可以自己搜索看看。
回答于 2019-06-14 10:46
基因家族共线性绘图时，画出来的图上只有一对基因连了红线
理解配置文件参数，及其他相关文件格式内容，画图控制显示文字标签的是text文件，对应主配置文件中的plot文字标签，如果需要显示更多或者更少的标签文字，自己修改text文件内容，增加自己想画出的标签信息即可，文件格式和方法参考：https://www.omicsclass.com/article/644
回答于 2019-06-14 09:12
请问老师，基因家族里面筛选到很多对重复基因，那么kaks计算只能...
把每一对获取的比对转换后的axt文件 整合（cat 命令）到一起，再借助KaKs_Calculator计算即可
回答于 2019-06-13 10:29
Circos绘图课程中有个叫genome.txt的配置文件，具体应该怎样生成
相关文件的生成在课程中绘图之后的下一节课有具体介绍各文件生成方法和脚本 具体参考：基因家族分析实操课程
回答于 2019-06-13 10:26
基因家族分析视频中Circos绘图课程有点看不懂
需要提出具体的问题才能针对性的回答 circos绘图的难点是主配置文件，搞懂配置文件中的参数的意义，每个区块对应控制图片的哪个部分就能比较好理解了，当然更多更详细更灵活的使用，需要个人做更多的探索，因为对应的控制参数和相关文件非常多，课程只能介绍较常使用的一部分。 你也可以参考网站的部分文章进行理解：http...
回答于 2019-06-13 10:25
conet构建网络图参数设置
参考课程：OTU网络图绘制 设置参数时可进行对应修改 如下图： 不同的文献实际实施的参数和方法将会有所差异，更具体的使用方法建议阅读CoNet插件的manual文件
回答于 2019-06-11 14:34