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生成MCScanX的gff文件时发现蛋白序列id是cds序列的id，请问怎么...
不太清楚你实际取用的ID是什么，但是gff文件中是会提供geneID和转录本ID之间的对应关系的，而每个CDS也是有所属的parent mRNA的 这个是能够对应上的
回答于 2019-06-06 09:09
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虚拟机软件使用问题
应该是没有设置环境变量 关于软件设置linux环境变量可以参考：https://www.omicsclass.com/article/387或者学习一些linux基础：linux系统使用
回答于 2019-06-03 09:34
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如何通过perl脚本实现blastn结果只取第一条，后面还有很多数据
blastn可以设置仅输入一个hit ，你可以查看这个命令的帮助，有一个参数 -max_target_seqs 可以进行控制
回答于 2019-06-03 09:17
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GEO基因差异分析中，数据提取后，进行组间筛选差异基因时，进行...
你自己对照阈值看看不就知道为什么没有差异基因了么。。。。。。。。如果你设置两倍上下调，log2FC绝对值是1 ，结合FDR 你的这个里面哪还有差异基因。有没有差异基因是根据阈值设定啊
回答于 2019-05-31 09:48
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老师，您好我想请教一下怎样知道某个基因具体富集到哪条KEGG通路...
查找该基因的注释信息，kegg中的注释理应会显示该基因于数据库中的编号，例如k01....这种的，然后去查一下对应的这个基因编号属于哪一个通路，或者会出现在哪些通路中。 注释富锦分析结果对应的文件表格会显示富集的通路包含哪些基因，你搜索一下对应的基因名称即可，可以参考参考转录组解读：转录组（有参）结果解读；转...
回答于 2019-05-30 16:27
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再用circos绘图时，染色体与标签的连线绘制不出来怎么回事？
cicors绘图很复杂，涉及的参数众多，文件也是重点，提供截图说明：涉及多个配置文件，并截图结果文件，不然并不能判断具体哪一块出问题。
回答于 2019-05-30 13:54