Daitoue
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cytoscape绘图问题

可能是软件问题 也可能参数问题,多倒腾几个参数 软件试试

回答于 2019-10-14 09:11

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circos问题

确认文字没错的话,一般位置太近 重叠了 你参考其他的参数修改一下: 1个是把文字放到圈外围 :https://www.omicsclass.com/article/644 2是可以调整图片大小:https://www.omicsclass.com/article/677 3是调整个别参数错开:https://www.omicsclass.com/article/678

回答于 2019-10-11 11:22

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在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时,对不能用转录组数据比...

这个指的是PCR 以及测序吧,根据已有的基因组位置信息去 设计引物PCR,可以得到基因组上实际的序列,然后送公司测序看看实际的序列碱基是什么样的。

回答于 2019-10-11 10:16

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老师您好,我想用R做GC含量分布曲线

有数据直接R写脚本画就好了,不限定非得linux下 perl中,还是说你不会调用R脚本的意思? R写脚本的话和你想要的图和实际数据有关 至少给个图例子,才知道数据对不对 调用的话可以用perl里面的system

回答于 2019-10-11 09:28

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在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时,对不能用转录组数据比...

最好给出文章位置截图 我猜测的是这篇文章 :https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4880-x 对应的涉及说到pcr的是这个位置(下图) 和后面其他的部分,粗略的看过之后文章中提到的是qPCR (或者qRT-PCR)它指的是实时荧光定量PCR 不是简单的PCR扩增,验证的是基因的相对表达量。

回答于 2019-10-11 09:24

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在菠萝文章里,哪个linkage groups是什么意思?和染色体有什么区...

连锁群的意思,概念和范畴就不一样,你可以去查一下这个概念 百度百科 或者 自己上wiki之类的 查一下标准的定义(文字链接点开就是对应的概念)

回答于 2019-10-11 09:14

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老师,您好,在学习样品与OTU二分网络图的绘制中,导入Cytoscape...

那个是样本测序的数据 不是简单计算的  相对测序样本中对应的OTU所占数量,只需要测序提供类似的占比数据就可以了

回答于 2019-10-08 11:27

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pacbio转录组数据处理

不是barcode.fasta文件 直接找测序公司要一下5p 和3p序列

回答于 2019-10-08 11:25

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无参转录组怎么分析?

主要差别就是比对组装上 有参是比对 组装 目的是鉴定新的转录本,而无参是没有参考基因组,需要基于测序的reads进行De novo组装,获得转录本序列 之后的差异分析相关内容类似。分析的主要核心流程是不同的

回答于 2019-09-29 13:59

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WGCNA运行代码问题sft

检查输入的几项参数 是不是有问题 ,包括由前面计算出来的结果,过程 是不是报错之类的。

回答于 2019-09-27 11:52