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甲基化生存分析
首先是理解ROC曲线的概念 和应用的意义 https://www.omicsclass.com/article/617 实际上是通过分类器选择一个最佳的相互制约的值，这个值对应的TPR越大越好，而FPR越小越好 这个就是进行划分的cutoff
回答于 2019-04-02 09:24
如何用hmmer软件中的hmmbuild程序构建MAPK的隐马尔科夫模型（HMM...
具体的可以按照文献说明的 method 进行操作，一般可能是通过文献或者相关网站下载其他物种的MAPK 序列，基于这些序列构建HMM 或者通过这些序列在目的物种内进行blast 获取同源序列 再进行HMM构建。 个人觉得你可以多看一些相关的文献，按照文献的方法对这种情况进行处理。
回答于 2019-04-01 10:19
老师好，我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时...
基因家族分析的时候选择的是基因的一个代表的转录本 画图的时候也可以用。前后统一对应，如果没有exon utr , 用cds 表示亦可
回答于 2019-04-01 10:15
老师，请问一下青蒿的基因组数组可以在那个网站上下载得到呢？
1、首先确定该物种确实已经完成测序 并数据公开了 2、可下载网站一般涉及： NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ensembel 植物部分：http://plants.ensembl.org/index.html JGI植物部分（phytozome) https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html#
回答于 2019-04-01 09:16
老师，麻烦您看一下我下载了这种series_matrix.txt 文件后续可以...
是不是双通道可以根据GEO数据库网页上样品处理等信息直接判断，建议你看看课程：GEO芯片数据挖掘， GEO芯片数据标准化 理解数据和芯片内容 另外建议从网站进行数据截图，这样看的比较明白
回答于 2019-03-28 12:19
物种有基因组，但是转录组做的无参，能分析基因家族的基因结构吗...
基于参考基因组 进行基因家族分析还是可以的，但是联合转录组分析的时候，无参分析得到的gene ID和参考基因组上的基因 对应的时候比较麻烦。
回答于 2019-03-27 17:31