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芯片探针解读
都是芯片标注的出来的相关名称，格式是正常的。如果你在GPL信息里面查看到了相关的解释知道是涉及什么功能的基因，可以选择保留，如果不想要也可以删除不进行后续分析。
回答于 2019-02-20 09:13
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WGCNA hub gene的解读
1、hub 基因指连通性高的 基因，严格的删选方法是通过连通性筛选，GS＞0.2，MM>0.8值的目的应该是 ——尽量选择 指定模块内和指定性状相关性较高的基因，并且这个基因在该模块内起到比较主导的作用——不是严格意义的hub基因。 2、基因表达是否变化和它是否属于hub基因没有直接关系，同一个模块内基因的表达协同性较高，统...
回答于 2019-02-19 16:34
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wgcna
hub基因和GS/MM 散点图的相关性解释上没有直接关系，它指的是模块内连通性高的点，不同的人可能会考虑其他的一些筛选方法，譬如你这里说的GS>0.2和MM》0.8 ，至于分析结果有没有意义，整体上看第一张图（模块和性状相关性热图），和BMI相关性高的也就是这两个模块，且p值在合理范围，建议是可以考虑使用的。
回答于 2019-02-18 11:52
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老师好，学习组学大讲堂WGCNA课程时，按照老师给的代码进行操作...
注意听清课程介绍，课程演示代码和实际保存文件代码之间的区别，重点理解 文件保存pdf的代码和含义
回答于 2019-02-18 11:43
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请问用cytoscape进行conet网络构建时原始数据文件是怎么得来的
一般都是公司提供分析的文件，只要格式上是一致的基本没有问题，出现报错问题比较多的，一般在于最后一列世系关系列，可以选择删除该列后，取消相应的世系关系列的设置进行分析。
回答于 2019-02-18 11:38
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MCScanX共线性图与拟南芥示例有些不一样
原因好像是染色体数量太多，亲测过~~如果绘图的时候染色体数量多，直接用MCScanX画图就这样了，直接用circos画图吧
回答于 2019-02-15 11:11
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