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在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与...
改改相关参数试试，你设置的模块最小也是80，而且相似性不太高1-0.35=0.65，可以尝试调整调整
回答于 2018-11-12 10:10
GEO数据库下载问题：我想要的GSE数据对应的GPL里面没有Annotatio...
进入对应的GSE数据页面，会有对应的数据描述，项目描述，各样品数据，以及相关的芯片信息，找一找是不是有GPL，或者你提供一下GSE accession
回答于 2018-11-12 10:06
circos图配置文件整理疑问
你圈选的那部分表示，1号和2号染色体之间的link 用color=255,225,255,04去染色而已，condition是设置一个条件，针对这个条件对所属的link进行设定。。。而已
回答于 2018-11-09 09:14
大神们，请教一个问题，在做ceRNA网络构建的时候，input文件里面...
补充一下数据，例如你说都有关系，指的是谁（A）和谁(B)以及谁(C) ，你输入的数据是否A和B对应 B和C对应，如此才能A--B--C 不分离，没有数据并不能看出来图片中哪一个节点应该和哪一个节点连在一起，另外，图片太糊了，瞅不清字 新的回答： 我觉得还是你数据问题，我根据截图的数据，自己手动输入整理 然后倒入软件，...
回答于 2018-11-07 11:55
GO富集二级分类柱状图和显著性气泡图的问题
二级分类柱状图应该试整体情况吧，气泡图这是针对显著的情况进行说明的，如果文章的重点讨论那些显著的情况当然气泡图更合适，二级分类更适合说明整体情况，仅做一个初步合概括性的了解而言。
回答于 2018-11-07 10:04
请问，OTU数据量较大，怎样用WGCNA包计算相关性的R值和P值，以及...
可以参考WGCNA包中的corAndPvalue 函数，之后借助其他函数对p值进行校正 譬如cor.test
回答于 2018-11-06 09:35
WGCNA分析中模块与性状正负相关性的意思？
要理解概念，正相关负相关相当于正向作用负向作用，二者变化趋势一致往往正相关，二者变化趋势相反往往而负相关，也就是协同性。
回答于 2018-11-02 09:56
ggplot2安装，library("ggplot2")出现这个问题,请问怎么解决
去安装colorscpace这个包看看 是不是这个包有影响，然后重新安装一下ggplot2
回答于 2018-10-31 17:17