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在mapman里，我要导入数据，但我的DEG文件，但有些数值是Inf 有...
这种的你设一个数值吧，远大于（或远小于）其他log2FC的数（看你的数据应该是log2FC），前后保证统一，这种非常大（小）的数据在显示热图的时候其实也超过了你设置的scale，图片影响不大。
回答于 2018-10-08 09:31
在使用mapman注释非模式植物时，为什么得出的结果没有相应的基因...
参考下图： 1、如果该基因被注释到某一个bin 会在文件第三列对应出现ID 如图中1； 2、在所有bin对应的分类中，并不是每一个都能被注释上基因（指你提供的那些基因），会出现空的情况 3、还有一些是在bin 分类中对应的M 类型，对应的都是一些蛋白酶之类的，如图中2，这个并不是你注释上的bin。 结合以上，你截的图应...
回答于 2018-09-30 10:17
老师您好，我在用conet对自己数据分析时，总是报错。
一般情况下报错是因为文件格式问题： 1、文件名使用英文拼写，不要出现出现空格，相关路径名称亦是 2、文件确保是tab分隔的txt文件，如不确保，建议通过另存成制表符分隔的文本文件后再操作
回答于 2018-09-07 17:13
mapman 中如何添加 生长素 乙烯 激素的 合成转运的pathway？
这种网站上没有的pathway，一般都是自己利用mapman做的 1、准备好比较清楚的图片png 作为通路图 2、按照mapping文件格式去准备mapping文件，文件中对应你准备map到该图片上进行标注的所有基因，并给定 bin 编号，相关描述等，导入mapman的mapping中， 3、在mapman 的pathyway部分选择add pathway，导入图片，在显示区图...
回答于 2018-08-30 18:28
R警告：大神能指点下嘛
你都没有截取全，只有报错，连输入命令是啥都不知道，再说了只是警告啊，不是error。你把代码截全一点。 1、代码内容、目的，形式 2、输入数据 这些都要描述的大家才能看出问题
回答于 2018-08-22 17:35
有关MeV软件分析K-Mean clustering的问题
官网下载软件压缩包，https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mev-tm4/MeV%204.9.0/ 完成解压后进入子文件夹documentation 一般会提供guide和manual文件4.9.0版你自己下载解压吧
回答于 2018-08-14 15:36
wgcna hub基因
借助WGCNA包中的函数chooseTopHubInEachModule()可以获得每个模块中的hubgene 具体可参考代码： datExpr指在WGCNA分析过程中经过初步分析筛选、剔除异常样品等之后生成的的最终分析表达数据矩阵（行名样品、列名基因），moduleColors为模块划分的结果 HubGenes <- chooseTopHubInEachModule(datExpr,moduleColors)wri...
回答于 2018-08-06 10:39