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我构建了Di19基因家族成员的圆形的进化树，里面包括拟南芥、玉米...
分类一般根据基因更细致的功能 结构之类的进行划分，可以参考meme 的motif分析结果，结合序列结构特征等等，同时阅读大量类似功能划分的文献吧，一般搞专门研究的理解和划分会更容易~
回答于 2019-08-24 10:53
老师您好，我想请问一下下面这个热图用R语言绘制（我买的是您这...
颜色设置白红吧，默认的没有的是空白 NA，或者对应了白， 应该和数据也有关系，具体的根据你的数据慢慢调整吧
回答于 2019-08-24 10:45
关于Rstudio最新版本中Biobase和GEOquery安装的问题
3.6版本R: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GEOquery") bioBase 安装类似： if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Biobase") 如需修改镜...
回答于 2019-08-12 11:20
WGCNA分析中cluster dendrogram图上的module colors只能显示一种...
您好~这个是哪个课程的代码？我这边看着好像不太像组学大讲堂对应WGCNA课程代码？看这个应该是基于一步构建的方法完成分析的 具体的问题检查一下画图输入的各个参数是不是和树以及模块对应~
回答于 2019-08-12 09:47
关于基因芯片affy包rma标准化
啊，这边没有直接指数化过这种处理，因为没有看见文献这么去做过，虽然看着像没什么问题。mas5.0的分析如果符合要求的话可以按照它的方法去获取未对数的结果
回答于 2019-08-09 14:48
WGCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cyt...
没试用过这种方法计算，所以不清楚具体的计算情况会怎么样，常规的利用代码就可以了，可参考链接：https://www.omicsclass.com/question/134/answer/140 每个模块都可以获取一个hub基因
回答于 2019-08-09 14:46