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有参转录组中，新基因是怎么回事？为什么会有新基因？
简单地说，是因为之前参考基因组注释不完全造成的，可以简单的理解为，参考考基因组某区域之前注释不是基因区，但是在本转录组实验中发现有很多reads比对到该区域，说明此区域有转录组本转录，所以此区域被重新注释为基因区，其对应的基因即为新基因。
回答于 2019-01-23 23:10
研究菌植物互作转录组取样，需注意什么？
尽量选取病灶部位进行取样，取样前确认取样的部分没有污染。可通过qPCR，显微镜观察或者生理生化表型等方法确定侵入种的占比，选择合适的侵染时期进行研究。
回答于 2019-01-17 11:02
转录组血液样品如何取样？
首先要区分全血、血浆还是血清，全血样品要用抗凝采血管采集（不推荐肝素抗凝管，可用EDTA、柠檬酸钠抗凝剂的抗凝管），采血后轻轻倒转采血管混合4~5次，使抗凝剂与血液混匀。将采集好的全血快速转移至单独的冻存管或离心管，按照每250ul/管分装，加750ul(即三倍体积)的Trizol LS（家禽、鱼类等红细胞有核物种，按照 1:8 或...
回答于 2019-01-17 11:00
植物转录组取样时如何操作？
首先要准备好液氮预冷的无酶管，并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理，尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本进行迅速采集，然后用RNase-free水对样品表面进行快速的清洗，吸干表面液体之后放入无酶管中液氮速冻，视取样大小冷冻时长，待彻底冷冻后，视取样大小冷冻时长转移至-80℃冰箱保存。
回答于 2019-01-17 10:57
为什么高通量测序很多reads会比对不到参考基因组上？为什么？
1. 所测物种与参考基因组物种差异较大； 2. 测序数据质量较低 3. 检查下是否存在其他物种数据污染 4. 参考基因组组装质量较差
回答于 2019-01-17 10:54
二代测序数据可否用于基因家族分析
不知你说的二代是指重测序还是转录组？基因家族分析大部分分析都是按参考基因组序列进行的，只有家族内基因表达模式变化分析是结合转录组表达量信息来做的，重测序数据无法使用。
回答于 2019-01-17 09:27
老师你好，我想问下，在做基因家族分析时，我的无参转录本里的un...
公司做的无参转录组中多是由对应的unigene的蛋白质序列的，位置参见cds_predict文件夹下，后缀是.pep文件，假如你对转录组结果不是很理解，读不懂结果文件，可以参考我们的《转录组（无参）结果解读》教程，能很好地协助你读懂转录组结果文件。
回答于 2019-01-14 17:34
无参转录组结果中，组装的转录组本有预测的蛋白序列吗？在什么位...
无参转录组中都有预测转录组的蛋白质序列，在组学生物的无参转录组结果文件中，预测的蛋白质序列文件位于4.cds_predict文件夹下的 unigene.pep.fa文件中。
回答于 2019-01-10 18:46