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我有F2群体，想做BSA，但是个别子代材料DNA不够了，怎么办？
F2单株假如无法提供足够的DNA，可从该F2单株的后代F3中，随机选择6~10株混提DNA来代替该F2。
回答于 2018-10-18 22:04
请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量
不知道您的物种是有参还是无参？假如有参的话，其实大部分分析内容如鉴定、加倍重复事件、染色体位置等都是根据基因组信息做的，只是家族内基因表达量是需要转录组表达量数据的；要是无参的话，那鉴定基因家族就需要组装出的unigene了，但像加倍重复事件、染色体位置分析就做不了了，但是像其他系统发育树、motif分析、家族...
回答于 2018-10-14 12:03
简化测序适合做BSA、遗传图、GWAS吗？
简化基因组测序技术，一般覆盖全基因组比例在1%~10%，基因组覆盖度小，开发变异少，易受酶切位点分布影响等，对于基因组复杂、多微效基因控制的数量性状等，简化测序发生漏检的几率较大；并且现在测序价格相对比较便宜，所以不建议使用简化基因组测序进行以上分析，当然对于无参物种或基因组特别大的物种，简化测序也是无奈...
回答于 2018-10-11 22:35
BSA没有关联到候选区间或定位效果差可能的原因有哪些？
一般BSA结果较差，可能由于以下原因： （1）表型鉴定错误或偏差，影响混池效果； （2）混池单株数过少，影响最后定位效果； （3）选取的材料性状不够极端，对于数量性状，应当取极端性状5%-10%的样品作为混池样品；对于质量性状，取尽量多的隐性性状个体和等数量的显性性状个体即可； （4）所研究物种与参考基因组物...
回答于 2018-10-11 22:27
转录组怎么和BSA结果联系起来？
BSA 结果关注的是DNA层面的变异，一般首先关注那些变异与目标性状有关；而转录组则是表达量/表达差异，揭示的是那些基因表达模式变化造成了目标性状差异，看似两者并无太多联系，但假如结合BSA两亲本转录组信息，可以了解BSA结果中候选区域内及附近区域基因表达模式变化，对于解释目标性状很有帮助。
回答于 2018-10-11 22:17
基因表达量可以查询吗
某基因在某组织部位的表达量当然是需要实时区测定的，可以通过实时荧光定量，半定量，以及转录组，表达谱等，网站上搜索你是说的搜索序列信息吧？基因序列信息可以网站搜索查询，基因表达具有时空特异性，需要具体材料具体采样时间，具体部位去测定。
回答于 2018-10-08 09:41