需要去除高丰度蛋白的常见样品包括血清、血浆和脑脊液等富含白蛋白和免疫球蛋白的样品,去除一般采用的去除高丰度蛋白试剂盒进行。
回答于 2019-08-09 16:05
(1)定量准确性:iTRAQ/TMT的定量准确性和重现性要明显优于Label-free,Label-free的样本之间不能直接混合,导致定量的结果受到的影响因素多,因此定量结果的准确度较低;(2)鉴定通量:Label-free通量相对较高,而iTRAQ/TMT由于标记基团的影响,鉴定通量较label-free 低;(3)修饰组学:label-free定量,修饰肽段的富集...
回答于 2019-08-09 15:56
别人发论文提交的数据一般是原始数据,想要得到这个实验里某些基因的表达量信息只能重新分析,也就是把转录组流程再跑一遍,这样就得到基因表达量信息了,但是这仅是这些基因在人家实验条件下的表达情况,假如他的和你的材料,处理条件等都一样,你也可以当做自己的数据来用的,希望能帮到你!假如需要分析数据可以联系我们...
回答于 2019-07-23 20:32
新基因预测分析是将测序Reads比对至参考基因组,然后进行拼接,其中一些reads比对到基因间区并且能拼接出完整的开放阅读框,拼接出来的位于基因间区的这些基因即为新基因。预测得到的新基因再进行功能注释,因此注释结果与新基因的鉴定没有关系。
回答于 2019-07-18 09:46
样品间的相关性反应了样品间的相似情况,样品间的相似度越高,样品间的差异基因越少。生物学组内重复样品的相关系数应大于组间样品的相关系数。 转录组测序通常要求设置至少3个生物学重复样本,如果出现某个样品与组内其它样本相关性不好的情况,可将该样本剔除,再进行差异分析。后期再通过生物学验证手段进行生物学验证...
回答于 2019-07-18 09:43
1. 可以从转录组水平整体评估外界条件引起的基因表达响应。 2. 对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有独特优势。 3. 可以发现基因融合、可变剪切及结构变异
回答于 2019-07-12 15:09
测序时每个循环在荧光基团淬灭,去3’端保护基团时,去除不彻底,导致在延伸过程滞留,或者是加入了无3’端保护的碱基,导致延伸超前,滞留和超前造成延伸步调不同,随着循环增加,超前或滞后的累积增多,测序错误率也就随之增高;另一方面,随着测序时间延长,酶活性及试剂的有效性都会降低,因为测序是先测read1,后测read2...
回答于 2019-07-04 20:01