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为什么read1和read2前几个碱基的错误率较高？
这是因为随机引物扩增的偏好性导致的，随机引物扩增偏好使得前边一些碱基的碱基含量不平衡，因而在base-calling的时候算法不准确，导致了错误率高。
回答于 2019-07-04 19:52
Paired-end与Single-end表示什么意思？
单端测序（Single-read）：是指测序引物结合位点只连接到待测片段的一端，然后末端加上接头，将片段固定在flowcell上形成簇，上机测序单端读取序列。 双端测序（Paired-end）：是指在构建待测文库时在两端都加上测序引物结合位点，在第一轮测序完成后，去除第一轮测序的模板链，用对读测序模块引导互补链在原位置再生和扩...
回答于 2019-06-14 15:45
转录组测序可以同时检测mRNA、miRNA及其他非编码RNA？
理论上技术是可行的，但是通常会根据测序对象长度的不同，在测序建库的时候会选择不同的片段大小，测序读长也会有不同。一般来讲，如果要进行microRNA测序的话，通常将microRNA分离出来，单独进行测序可。mRNA测序，通常建库时选择300bp大小片段，采用150PE测序。而长链非编码RNA（lncRNA）存在正向转录和反向转录，所以常...
回答于 2019-06-14 15:42
转录因子和转录调节因子的异同
你写的应该可以理解为一个东西，但是你看看是否表述不太准确，你是不是说转录因子与转录共调控因子？转录组共调控因子：又称转录中介因子(trancriptional intermediary factors,TIF)/共调节因子(co-regulators)、 DNA 共激活因子(co-activators)，是指能与转录调节因子结合，可以提高它们的转录激活。
回答于 2019-06-11 11:25
CDNA和gDNA 的区别
gDNA(genomic DNA，基因组DNA）：是指有机体在单倍体状态下的DNA全部含量。广义的基因组也指某一体系(如核或细胞器)中的DNA，它包括编码或细胞中固有的核糖体DNA(rDNA)、线粒体DNA(mtDNA)、tRNA基因及其它RNA编码。 cDNA是以mRNA为模板,在适当引物的存在下,由mRNA经过反转录而得到的DNA，是mRNA链互补的DNA链，其内部已无...
回答于 2019-06-04 22:14
转录组结果中的log2 fold change和q-value，分别表示什么意义？
1，fold change的意思是样本间表达量的差异倍数，log2 fold change的意思是取log2，这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距。2，Q-value，是P-value校正值，P值是统计差异的显著性的。Q值比P值更严格的一种统计。
回答于 2019-06-01 13:56
我要做树木枝条的转录组，取样如何操作？
1、 将样品剪碎成长宽高均小于5mm的小块，使用2 ml或5ml灭菌EP管分装； 2、 在管盖和管壁上均标注样品编号； 3、 写上编号之后，使用封口膜或保鲜膜封口及管壁并覆盖所写标记，以避免样品运输过程中，标记磨损； 每管200-300mg左右，每个样品分装3-4管；
回答于 2019-06-01 13:46
顺式作用元件分析分析DNA还是RNA水平？分析时一般提取多长序列？
顺势作用元件是位于DNA上的，所以分析是在DNA水平进行的，一般提取基因起始密码子前1000-2000bp进行分析。
回答于 2019-05-18 16:59
什么是顺式作用元件？
顺式作用元件(cis-acting element)是存在于基因旁侧序列中，能影响基因表达的一段DNA序列，它们的作用是参与基因表达的调控；顺式作用元件本身不编码任何蛋白质，仅仅提供一个作用位点，要与反式作用因子（多是转录组因子）相互作用而起作用。
回答于 2019-05-18 16:55
有参转录组结果中的geneID是转录组本的ID吗？
不是，有参转录组中的geneID即是所参考基因组中的基因ID，可以在相应的基因组下载网站下载该物种基因组的GFF文件，然后根据GFF注释信息里的基因ID找到对应的转录本ID信息。
回答于 2019-05-09 22:16