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TCGA生存分析中表达数据只有肿瘤数据吗？我自行下载的TCGA数据是...
生存分析是采用病人癌症组织的样本进行的分析。 1. 它针对的癌症组织中的分子表达情况对“病人”的生存状况的影响。 2. 如果您的数据中有“癌旁”样本，那就导致同一个病人的编号出现重复。
回答于 2018-07-18 11:57
flexbar2.2版本去接头的过程中format不正确，报错文件格式不正确...
参数“拼写错误”：做生信分析，经常会遇到问题，可以参考如下的步骤解决： 1. 首先检查一下代码，是否有拼写错误，使用错误2. 查看软件的使用说明文档，分析错误的原因 3. google 搜索问题，是否有同样或类似问题，有没有解决方案 4. 论坛，社区向高手请教
回答于 2018-07-18 11:40
老师，您好！想请教一下，这几个问题纠结了一个月了，麻烦老师了...
1. 不同的基因组版本，除了基因组序列不一致以外，基因的注释信息也有可能不太一样。一个基因有多个转录本，每个转录本都可能有5‘UTR，所以你要确定你研究的是基因的那个转录本。 2. 一般基因组的注释，如果有5‘UTR的注释，那么肯定是用转录组的数据进行了优化的，因为算法预测，一般是预测编码区。 3. 基因的一般都有多...
回答于 2018-07-17 14:01
基因组里5UTR注释
1. NCBI数据库中，原核生物的基因一般采用电子注释，而真核生物的基因注释一般采用电子注释+转录组校正（实验验证）。 2. hg19 和hg38 基因的位置注释信息可能有不同，需要具体的看一下，提取序列是否有问题 3. 一个基因一般都含有多个不同的转录本，转录本的结构，可以按照是否能编码蛋白，分为3部分，分别是5‘UTR， CDS...
回答于 2018-07-16 13:19
有那些网站可以在线进行基因功能富集分析？
功能富集的网站有： 1. KOBAS : 北京大学的一个基因功能注释网站，不过该网站不是很稳定，即使在国内，有时候也不能访问。
回答于 2018-07-12 11:00
平台注释文件里没有Gene Symbol 怎么做GSEA分析？
如果芯片中没有Gene Symbol 的注释信息，可以细看一下注释文件中是否有其他的ID ，再看看其他的ID能否转换成Gene Symbol
回答于 2018-07-12 10:55
可以采用差异表达基因进行WGCNA分析吗？
从WGCNA的数学原理来看，这样做出的效果不好，从官方文档来看，也是不推荐这么做的。 很多文章，虽然采用这样的方法进行了分析，但是这都是玩的数学游戏，因为无论你用WGCNA怎么计算，都会有一个结果。
回答于 2018-07-12 09:35