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在基因家族分析的第四节课中，我得到的比对序列数量和视频讲解中...
1. 从两者结果的数量来看，差别不是很大。具体差异，可以将基因的ID做一个韦恩图看看，有那些基因存在差异 2. 你所使用的软件版本，跟课堂提供的版本稍微有点差别，你使用的是3.1b2， 而课程中提供的是3.1by1. 可能是由于这个原因导致的
回答于 2018-10-28 11:00
TCGA分析得到的risk score如何用自己的数据进行验证，定量pcr可...
从TCGA得到的那个risk score 是针对测序数据的，不能直接用于PCR验证，因为两者的表达（单位）不一样。如果要验证的话，最好能用一些样本的PCR定量数据，从新构建基于PCR数据的risk socre 标准。但是 如果没有那么多样本的话，也可以简单的基PCR 数据看看趋势。
回答于 2018-10-25 11:10
老师你好，之前看组学大讲堂关于基因下载的视频，照着步骤做，但...
1. 从错误来看，是下载的一个数据有问题，但是可以考虑一下，是不是在同一目录下面下载过多次数据，导致数据混乱？ 2. 建议： 换到一个新的工作目录，重新下载数据。
回答于 2018-10-25 10:55
转录组分组间差异基因分析
1. 首先，你这个有没有生物学重复呀？ 2. 如果没有生物学重复的话，你的这些差别比较大，考虑一下样品处理或分析有问题。 3. 你这差异基因9000多，物种是无参的吧 ？ 4. 是否需要分析A和C的对比，看你想研究的问题，A和C有差别，能说明什么问题 ？
回答于 2018-10-25 10:49
TPM标准化
外显子的长度。 有几个相关的概念，你可以了解一下。 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads FPKM: Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments RPM/CPM: Reads/Counts of exon model per Million mapped reads TPM：Transcripts Per Kilobase of exon model pe...
回答于 2018-10-17 10:16
利用Heatmapper在线网站绘制基因编号时不显示基因ID，只显示数字...
这个应该是数据格式的问题。 1. 建议将数据在excel 中编码好格式，再将数据存成txt 文本格式。 2. 还是不行的话，请提供数据，我帮你看看具体的原因
回答于 2018-10-08 15:04
转录组数据概况
没明白你提问的目的 1. 如果是描述你实验数据的概括，你可以描述为几个样本，做了3次生物学重复，平均每个样本测了多少数据。 2. 生物学重复：那肯定是不同的生物样本，你得有3次的数据，而不是拿三个样本，混在一起，做一个文库，只测序一次。如果你这个做的话，很可能在发文章时，被评审质疑。
回答于 2018-10-08 10:03