169 个回答
你好，不知道使用Rstudio软件如何提取mRNA 表达量矩阵?如何获取m...
你这问题描述的不准确。1. mRNA_info,txt 这个文件，在《TCGA-基因差异表达分析》课程的资料里有。 2. 提取TCGA 中mRNA 的表达矩阵，请看课程的基因表达量提取部分。
回答于 2018-09-29 10:09
WGCNA分析过程中做样品聚类树与形状热图时遇到问题
遇到这种问题，先查看一下函数中的输入变量 是否正常吧。你这个问题，可以先看看“ datTraits” 里面的值是否有问题。
回答于 2018-09-28 09:47
三代纠错软件lordec安装问题
“/usr/local/HDF_Group/HDF5/1.8.18/examples” 从这个信息看，应该是你没有这个目录的权限，让系统管理员帮你安装吧。
回答于 2018-09-28 09:43
TCGA数据生存时间怎么确定？
这个不难，直接上我课程中的代码，你自己看吧。 有兴趣的话，可以学习我的《TCGA-生存分析》课程，里面有讲到，如何处理临床数据。
回答于 2018-09-27 10:03
我想用两个基因组去比对我的转录组，但公司告知我这两个基因组都...
1. 需要第一张图所示的注释文件， 注释的对象是gene， mRNA, exon 。 2. 第二张图是基因组重复序列的注释，转录组分析，不需要。
回答于 2018-09-26 17:33
生存分析
1. 建议在全部的患者中做。 2. 做生存分析时，将性别作为一个因素放入到分析模型中，进行分析 3. 结果的解释，需要基于生存分析出来的结果，目前不太好下定论。
回答于 2018-09-25 16:52
TCGA生存分析cut off值疑问
1. 2500 : 这个是估计的中位生存期。 准确的数字应该是2888 。 2. ROC 曲线，我们采用的是risk score ，选择的时间是估计的中位生存期。你可以细看一下survivalROC 这个函数。
回答于 2018-09-25 11:58
如何分析从数据库下载的转录组信息
您的问题太不具体了，1. 什么数据库？2. 什么样的数据，有没有数据的编号，描述信息 3. 你需要从这些数据中获取哪些信息 ？
回答于 2018-09-25 10:24