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69 个回答

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老师您好,我在提取cds的时候报错了。他说第84行出错,然后我打...

报错说 gff3_file_to_proteins.pl 脚本第84行的报错提示。根据Error, no sequence for Chr1的报错,可能是 $genome 变量下的Chr1染色体有问题,仔细检查一下

回答于 1天前

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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单,在标识了转...

seqkit grep 命令是 根据-f 选项文件中的 ID 提取序列。ID不一致不会提取出来,ID必须一致。

回答于 1天前

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代谢组数据正态检验

log转换是对同一代谢物在不同样本下是丰度进行处理

回答于 3天前

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文献给的下载基因组网站下载不了花生基因组数据,ensemble下载的...

这个,去数据库网站尝试一下下载。https://www.omicsclass.com/article/525

回答于 3天前

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A基因家族的家族成员一共25个,但是23个成员是一个domain,只有...

同一个基因家族的成员之间构建蛋白全长进化树一般都会成功的。不过结构域进化树更能表达出基因之间的相似度

回答于 5天前

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新建物种特异hmm模型,再次搜索,产生的文件round2_hmmerOut.txt...

基因家族结构域比对上长度太短,是残基,一般选择不要

回答于 2025-04-10 17:40

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代谢组进行差异代谢物筛选时,必须对t检验的p值进行fdr矫正吗?...

如果不想对P值进行方法矫正的话,可以在运行脚本04.DEManalysis.R时, -a选项选择 none参数。这样-q选项是对pvalue值进行筛选

回答于 2025-04-07 09:38

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提取cds 用基因的ID,作为序列的ID,报错,咋整?

报错提示没有找到该路径下的脚本文件,应该是$scriptsdir参数没设置

回答于 2025-03-27 18:49

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Arabidopsis_thaliana.TAIR10.56.gff3.gz 课程资料发我的gff文件...

没有也不影响分析

回答于 2025-03-27 18:48

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服务器FZ上上传文件,如果出现了说错误命令,即便只有一条错误命...

你去看一下文件是否正确传输,文件大小跟源文件是否一致。如果显示成功的话一般不用重新传

回答于 2025-03-26 13:42