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蛋白质全长多序列比对
根据多序列比对图，将对应的字母放到对应的位置。也就是，你看其他基因在序列那个位置上有WRKYGQK，就把这个基因上的WRKYGQK放到对应位置。不是简单的对结构域中间横杠去掉。同时保证所有比对序列长度一致，缺失位置都用-填充
回答于 2024-08-30 18:24
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基因家族鉴定
在线数据库筛选问题，可能残缺的基因家族结构域也会识别出来。可以做多序列比对，不想要的结果就删掉。 另外在线数据库的结构域区域展示中，上面那条序列是自己输入的序列，下面的序列是数据库里的序列。不是自己想选那条的问题。
回答于 2024-08-30 09:24
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hmmer搜索结构域
你可以指出具体的基因。看多序列比对截图不完整看不出来那里有问题。 比对结果WRKY_hmmerOut_final.txt中第16、17列大都是 1-59 完整结构域。不会出现锌指结构不全的情况。结构里没有可能就是保守性太低。 结构域缺失较多的基因，CDD数据库中却显示有结构。可以看具体比对上的区域序列有没有锌指结构。
回答于 2024-08-28 16:23