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blast比对得到的基因进行构树，无法与拟南芥基因进行聚类
如果用鉴定结果的蛋白全长序列比对的话，可能序列之间差异比较大导致这种现象。可以考虑对多序列比对不保守的部分进行剪切
回答于 2024-11-12 10:55
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安装本地docker出现错误
首先确认docker 是否安装并打开。在 当前命令行界面 中运行 docker version 命令，是否能正确输出docker 版本信息。具体安装操作可以参考：https://www.omicsclass.com/article/1198。 正确打开之后再去安装基因家族分析镜像
回答于 2024-10-29 13:23
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成功得到了gvcf文件后，合并gvcf文件时，在导入db步骤中，由于gv...
使用GATKA中的 IndexFeatureFile 工具来构建索引。gatk --java-options "-Xmx50g" IndexFeatureFile -I **.g.vcf.gz
回答于 2024-10-18 11:27
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基因组间共线性分析作图问题
最简单的就是在Adobe Illustrator软件中手动对染色体label进行修改，染色体名称很长可以使用缩写、重命名或者把label竖着写。 也可以在绘图时对mcscan_layout和mcscan_seqid配置文件中，所有用到的绘图文件的染色体label，全部重命名。
回答于 2024-10-11 09:37
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MCScanX这一步做完分析后发现了问题
WRKY.tandem文件是从第八步复制过来的。如果本身是空的证明该基因家族没有串联重复基因对。 另一个文件是那一步的？可能是本身没有结果
回答于 2024-09-23 15:30
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