2021-04-15 15:20 发起提问

2021-04-15 15:16 回答问题

老师您好，我得问题是这样的，这是我拿到的VCF文件，我想生成SNP表来进行GWAS分析，我有一下几个问题： 1.REF和ALT如果显示碱基数量大于一个，但是只有一个有差异，那我在生成SNP表格的时候是按照那个不一样的表示吗？ 2.关于样本的命名：每一个前面都有sm的标号，这个文件里有188sm 90sm和9sm，老师请问不同sm标号是因为他们测序时分批测得吗？是不是可以理解为188sm命名得那一组属于一个时间段测序的。 3：老师，样本下的GT如果为杂合子0/1，请问老师这个SNP位点的碱基参考的是RE

2021-04-15 11:33 发起提问

2021-04-15 11:30 回答问题

老师，请问缺失的在snp表中怎么表示