小兰老师的课程早就都更新了,你可以在网易云课堂上看看最新版的。 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-09-27 09:57
当差异基因很少的情况下,如果调整FDR和差异倍数都无法增加差异数量的话。退而求其次的方法就是直接使用pvalue值来筛选差异。这样差异的数量可能会多一些。不过相应的假阳性也会高一点。 不过有些样品,比如细胞样品,由于背景相似度非常高,很有可能出现差异很少的情况。这时候就可以酌情考虑直接使用pvalue值。通过pvalu...
回答于 2020-09-19 15:58
非编码RNA是没有功能的,比如lncRNA、microRNA、circRNA等,如果要研究功能,需要研究这些RNA的靶基因或者来源基因的功能。
回答于 2020-09-08 08:59
你想计算FPKM的话,你得有测序的原始数据,然后使用原始数据从头分析,然后计算FPKM值。 如果你研究的物种有参考基因组的话,可以学习我们的 RNAseq有参转录组数据自主分析 https://study.163.com/course/introduction/1005267042.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-08-18 08:38
你的命令路径有问题,你检查一下。另外我看你没有按照视频的目录结构进行操作,你再看看视频,在没有完全理解学会的情况下,建议严格按照视频的目录路径进行分析。
回答于 2020-08-18 08:36