生信老顽童
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228 个回答

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研究非编码RNA功能的方法有哪些?该如何选择?

非编码RNA是没有功能的,比如lncRNA、microRNA、circRNA等,如果要研究功能,需要研究这些RNA的靶基因或者来源基因的功能。

回答于 2020-09-08 08:59

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如何获取苹果所有蛋白在kegg中的大K号?

那你需要进行kegg注释之后才知道。

回答于 2020-09-05 09:55

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Omicsclass的网站源文件在哪里下载呢

你直接在docker下下载相应的镜像即可。

回答于 2020-08-26 09:06

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老师,mega构建好的进化树,怎么导不出来,按照步骤来的,点导出...

你得看看你导出的什么格式的,没有导出来应该是你某个步骤出错了。你再操作一下吧

回答于 2020-08-23 15:51

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老师,您好,请问一下利用基因在不同组织的FPKM值做热图,怎样计...

你想计算FPKM的话,你得有测序的原始数据,然后使用原始数据从头分析,然后计算FPKM值。 如果你研究的物种有参考基因组的话,可以学习我们的 RNAseq有参转录组数据自主分析 https://study.163.com/course/introduction/1005267042.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-08-18 08:38

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docker 运行meme motif analysis 时显示无meme这个文件

你的命令路径有问题,你检查一下。另外我看你没有按照视频的目录结构进行操作,你再看看视频,在没有完全理解学会的情况下,建议严格按照视频的目录路径进行分析。

回答于 2020-08-18 08:36

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老师,在ensemble下载斑马鱼和大黄鱼的时候,gff3文件和pep等的I...

你最好贴一下你的gff文件,我们才能给你提出修改建议。

回答于 2020-08-15 12:36

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老师,比如说我要做两个物种基因家族的对比分析,那我要不要选一...

可以选择也可以不选择。如果你关注的家族基因在你研究的两个物种中数量比较多,呢么也可以不再添加其他物种。如果数量比较少的话,可以考虑添加,比如加上拟南芥

回答于 2020-08-15 12:35

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提取保守结构域

如果是序列差异大的话,可以适当删除一些差异大的序列或者gap,然后再尝试构树。 建议学习我们的基因家族分析课程https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-08-13 12:54

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老师你好!构建进化树的时候,需要把目标基因家族的基因进行亚族...

可以根据不同的分支进行分组,比如在一个亚枝上的为一组。也可以参考其他物种比如拟南芥的情况来分组。

回答于 2020-08-11 08:55