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请问如何从无参转录组的fasta数据中，找到一些拟南芥的同源序列...
测序数据是短片段的序列，你可以通过比对看出哪些序列比对上了你的目的基因。不过最好建议你拿你的目的基因和无参转录组组装得到的unigene进行blast，比对率高的可能就是同源基因。
回答于 2020-07-31 09:04
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老师您好，知道拟南芥基因家族名称，也知道成员的基因名，怎样找...
那你下载基因组相关文件：基因组序列文件、cds文件、蛋白序列文件、gff文件，然后根据你的基因名称或者ID把相应的序列提取出来即可。不过整套的基因家族分析建议学习： https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-07-28 16:09
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报了基因家族鉴定的课，之前装ova的时候用的是官网的，但是很多...
那你按照课程里讲的重新下载安装一下即可。不要使用官网的，要使用我们组学大讲堂提供的。https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2020-07-28 16:06
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https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/versions/plaza_v4_...
这个就需要你看看网站的说明或者网站的相关介绍了。
回答于 2020-07-25 12:19
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进行基因家族成员鉴定的时候，是不是在hmmsearch搜索后，只要用C...
搜索鉴定之后，数据库确认结构域，如果存在就可以判断是这个家族的基因。有兴趣的话可以学习我们基因家族分析的课程。 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-07-23 09:01
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请问pfam号一般都是整数的吗，我看到一篇文章里pfam 号是带小数...
你可以把你看到的pfam号在pfam数据库里搜索一下看看，看看有没有对应的搜索结果，看看数据库里是怎么解释的。
回答于 2020-07-18 23:08