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基因家族候选基因结构域鉴定 老师你好！做bhlh基因家族分析，对...
我不知道你的鉴定思路和方法是什么，如果学我们的课程，一般是先搜索pfam结构域，找到之后，使用结构域进行hmmer搜索，然后对搜索到的结果进行数据库确认，剔除那些没有结构域的基因，同时，每个基因保留一个转录本ID。 具体的可以学习我们的基因家族分析课程：https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?...
回答于 2020-06-10 08:42
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请问hmmsearch E-value如何设置
如果你学了我们的基因家族分析课程的话，按照课程里讲的用即可。 如果没有学的话，建议越小越好。可以看看基因家族分析的相关文献。 我们的课程链接： https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-06-05 10:49
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请问老师做无参转录组分析某一家族基因可以把其核苷酸序列翻译为...
无参会有三个序列文件，一个是unigene的序列、cds的序列、pep的序列。如果没的话，你可以翻译一下。
回答于 2020-06-05 09:00
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/biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT
软件的安装，初学者搞定不了。你下载我们提供的版本吧。https://www.omicsclass.com/article/526或者，在windows安装docker，然后下载我们组学大讲堂提供的基因家族分析镜像，就不会有软件安装的问题了。
回答于 2020-06-05 08:58
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做某基因家族共线性分析产生.collinearity 和.tandem这两个文件...
每一步生成的文件都要打开看看，确定没有问题之后再进行下一步。 另外，在打开看的时候要注意，不要做多余的操作，有时候不小心按错了，就有可能把文件内容删除掉。所以，如果发现文件内容为空，那就从上一步再按照命令运行一次。
回答于 2020-06-04 08:43
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