生信老顽童
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228 个回答

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老师您好,请问家族蛋白基因多序列比较分析的研究思路是什么呢?

先搜索结构域,进行鉴定,然后进行比对,构树、共线性分析、motif、基因结构等等。 可以参考我们的课程: 基因家族 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-06-03 08:48

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老师您好!请问对不同物种的同一家族蛋白基因序列进行多序列比较...

先把每个物种的该家族基因鉴定出来,然后把序列合并进行多序列比对即可。

回答于 2020-06-03 08:45

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请问GSDS老是打不开,还有其他软件作基因结构图吗?

网站服务器有时候会因为各种问题而需要维护,所以如果打不开了,就等等再用。现在应该是可以用了。

回答于 2020-06-02 08:55

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老师,您好,能不能把miRNA与靶基因相关性Correlation_analysis....

脚本都是公司的东西,不能随便给的。抱歉。

回答于 2020-06-02 08:48

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虚拟机导入成功,但是设置的时候出现问题,发现无效设置,OK键也...

截图详细说明一下,没有图,没法判断问题

回答于 2020-06-02 08:48

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老师,基因家族数量太多,如何提取domain序列构建进化树呢?

这个在我们的课程里有讲,有相应脚本批量提取的。 如果买过课程的,可以仔细看看视频,里面讲的很清楚。 没有的话,建议学习一下课程 链接:https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705  

回答于 2020-05-30 13:42

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老师,请问基因家族数量太多,如何确定其中的假基因,是否可以每...

根据数据库进行结构域确认,比如pfam、smart等

回答于 2020-05-30 13:38

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我想请教一个问题,如果没有GFF文件,能从基因组中进行基因序列...

么有gff文件是无法提取基因序列的,gff文件记录了基因的位置信息,没有位置信息无法提取序列。 基因组的gff文件是一定有的,只是有些没有上传到公开的数据库,你可以找基因组对应的文章作者要一下。

回答于 2020-05-30 13:37

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老师,您好!对于NCBI上没有公布基因组注释文件的,我该怎么去找...

找找其他数据库里有没有,或者根据NCBI上的基因组对应的文章,找作者要一下。

回答于 2020-05-28 08:17

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老师您好,我弄基于转录组的基因家族分析时,我已经知道了基因家...

会写脚本的可以写个脚本批量提取,不会的话,就用笨方法一个个搜索复制粘贴。 既然做基因家族分析,建议学习一下我们的基因家族分析可 基因家族 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705 如果没有linux基础,想学习的更好,可以学习一下Linux系统的使用 https://s...

回答于 2020-05-28 08:14