生信老顽童的回答 - 组学大讲堂问答社区

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各位老师好，请问无参转录组（没参考基因组）做基因家族分析能发...

无参的可以做基因家族分析，只是和染色体或者基因结构的分析做不了。比如共线性分析、基因结构分析、染色体定位等。后续也是做些定量验证、亚细胞定位等试验即可。有兴趣的话，可以微信联系18510686562详聊，我们组学大讲堂可以做相关分析服务。

回答于 2023-10-04 13:40

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在基因家族分析课程里有下载说明，课程链接：https://bdtcd.xet.tech/s/1xkBdl

回答于 2023-08-18 14:53

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https://www.omicsclass.com/article/2035可以参考这个试试

回答于 2023-08-07 09:38

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你检查一下你的镜像是否使用正确，还有数据格式是否正确。

回答于 2023-08-05 16:38

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和参考基因组比对率低，那大概率是菌株污染了。你可以自己查一下样品

回答于 2023-08-01 17:43

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那你得做GWAS关联分析，就可以找到和性状相关的关联位点，然后就可以得到候选区间和基因。

回答于 2023-08-01 17:42

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你查看一下基因ID是不是一致。

回答于 2023-07-29 11:32

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可以做，做完之后，你可以从进化上看看群体材料的差别。

回答于 2023-07-28 10:30

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我们分析项目，都是尽量不使用NCBI上的基因组，基因格式不行。当然，你也可以把两套基因组的基因序列拿来做个blast比对，看看哪些能比对上。

回答于 2023-07-21 08:24

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这个取消就没有了。到期了。现在有相关课程https://bdtcd.xet.tech/s/47k2HL，这个课程比之前的代码要详细，分析内容更全面。之前分享的代码就是简单的分析

回答于 2023-07-11 11:03