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三代转录组和二代转录组取样上有什么区别吗？
你好，三代全长转录组取样上没有特殊要求，都是液氮速冻，然后保存或者直接提取RNA，不过三代全长转录组对RNA的质量和总量要求要高很多，建议三代测序的样品让公司去提取。
回答于 2019-09-04 14:00
做重测序取样和做转录组取样要求一样吗？
重测序测的是样品的DNA，不随时间而变化，通常也不随组织部位而变化（癌变、芽变等特殊情况除外），尽量取好提取DNA的部位就行了。 转录组测的是样品的RNA，有时空表达特异性，需要根据研究目的挑选组织部位和取样时间。 在样品处理上，转录组的要求要高于重测序，毕竟RNA容易降解。建议都用液氮速冻后放到1.5ml EP管或者...
回答于 2019-08-25 09:53
做无参转录组和有参转录组对服务器要求区别大吗？
有参和无参对服务器的要求差别还是挺大的，CPU方面主要是影响分析速度，预算内肯定是越强越好，不过低点也能分析。 但是在内存这一块，无参转录组的分析牵涉到组装，需要大量的内存，内存量不足就完全没法分析了。 如果既要按有参做又要按无参做的话，内存一定不能少了，建议200G以上的内存。
回答于 2019-08-09 11:42
snp-index算法具体是怎么算的
计算方法简述如下： Maa 表示 aa 群体来源于 M 的深度；Paa 表示 aa 群体来源于父本的深度； Mab 表示 ab 群体来源于 M 的深度；Pab 表示 ab 群体来源于父本的深度； SNP-index(ab)=Mab/(Pab+Mab)；SNP-index(aa)=Maa/(Paa+Maa)。 Δ(SNP-index)=SNP-index(aa)-SNP-index(ab)。 通过在基因组上选择一定大小的...
回答于 2019-08-02 12:23
学习R语言对电脑要求高吗？
R语言可以在Windows下运行，无需安装虚拟机，大部分的功能对电脑的要求都是很低的，普通的i3处理器，2G内存即可，所以放心学吧
回答于 2019-07-24 16:03
怎么给外地的公司发原始数据呢？
最稳妥的办法自然是用移动硬盘寄过去，不过需要花些钱邮寄 如果手边没有有移动硬盘，老板又不想报销邮寄费的话，可以用百度网盘进行传输，不过百度网盘由于一些众所周知的原因，非VIP会员速度超级慢，传转录组原始数据的话，实在太慢了。 在这里推荐一个百度网盘的破解速度限制工具：pandownload，下载地址：http://pando...
回答于 2019-07-18 17:14
转录组取样应该注意些什么？
根系取样的时候，需要用PBS将根系冲洗干净，然后迅速扔到装有液氮的盒子里速冻，速冻完成之后，将组织装进冻存管，写清标记，然后把管子扔到液氮罐或者-80℃冰箱备用。 关键在于速冻和低温保存，否则RNA容易降解。
回答于 2019-07-11 14:47
想绘图应该学R语言还是perl语言呢
R语言和Perl语言的功能并不是相斥的，有很多功能都两者都能实现的。当然两者各有其强项，从生物数据作图来说，推荐学R语言，R语言有强大的绘图功能，而perl在数据的批量处理方面更有优势。
回答于 2019-07-05 15:09
二代测序和三代测序做转录组有什么区别？
二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜，读长短（一般是PE150），但是reads数量巨大，6G数据量就有2000万的reads了，适合用来做表达定量。 三代测序，目前两家主流的是PacBio和nanopore，价格远高于二代测序，优点是读长长，适合用来获取全长基因或者研究基因结构，但是reads数量一般，用来做定量的话，不是...
回答于 2019-06-26 09:50
你好这个问答系统好用吗？
提问、回答是本社区的一大功能，问的人提供的信息具体，全面，才能获得他人的准确帮助 同时也有不少同学在社区里记录自己的学习历程，这些记录又能帮助后来者解决类似的问题
回答于 2019-06-24 23:50