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xun - 电路元件工程师

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31 个回答

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deblur生成featrue-table出现错误

关闭这个docker重新创建一个,然后加载qiime环境重新执行这个代码,

回答于 2024-10-28 10:32

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请问老师这个LDA图中的other为什莫会出现呢,如何去除,直接在图...

可以,你也可以在原始数据里删掉最后是Other 的,注释精度有的达不到种

回答于 2024-10-15 09:05

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数据质量查看遇到问题,后续,代码又试了没问题,但是好像缺了什...

额,权限看起来还是没改成功,试试这个 chmod 777 /work/my-ampliseq/tmp/qiime2 执行完以后再执行qiime 的代码 如果还是报相似的错误,就直接删除这个临时目录 rm -rf /work/my-ampliseq/tmp/qiime2

回答于 2024-10-11 09:08

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数据质量查看出现问题

没有权限, chmod -R 755 /work/my-amplicseq/tmp 执行这个调一下

回答于 2024-10-09 09:03

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16s分析,数据导入过程中出现了问题,请问怎样解决?

rm -rf /work/my-amplicseq/tmp/qiime2把这个目录删掉执行完如果还是报错,就调一下权限chmod 0755 /work/my-amplicseq/tmp/qiime2

回答于 2024-09-29 11:05

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我已经将env.sh中文件的路径改为我自己的路径了,但是为什么这代...

这个env.sh.你需要和你在docker里实际的路径相匹配,也就是说docker里是啥路径是啥你这里就写啥,你改了你的路径,但是我猜你没有改进入docker 的那条命令,(不确定哈)你可以再把你进入docker以后的界面还有你的docker,sh那个命令给我截个图看看

回答于 2024-09-18 09:50

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老师,我想请问一下这个图一直上升是因为抽平深度不够吗?

不出意外的话是,这是你自己的项目吗,因为如果样本间实验条件差异比较大出现这种情况也是正常的,我们抽平一般是按最小的那个样本的序列数来抽,但是你这个样本数有点太多,必要的话得把那几个序列数很少的舍掉,否则整体的数据损失就有点大,

回答于 2024-09-14 17:57

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想知道出现A2这种情况是因为数据的原因吗

是的,你这个样本可能有点问题,和其他样本差异过大,可以试试调低过滤的阈值再跑一下,不过你的数据组内差异咋也那么大啊

回答于 2024-09-11 18:01

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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但...

这一步叫做去噪,就是用来合并相似reads(大概意思) 的

回答于 2024-09-02 09:24

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#16S 分析 deblur的方法应用时报错,如下图,前面的数据是严格按...

报错信息不多,试试线程数调低跑

回答于 2024-09-02 09:23