31 个回答
RepeatModeler续跑
RepeatClassifier -consensi consensi.fa分类用这个工具就行, RepeatClassifier 如果还是不行就重新跑一遍吧
回答于 2024-07-24 09:36
老师，这些文件在filezilla里下载不了，原因是无法启动传输。然...
因为这些文件是链接文件,不是实际的文件只是一个指向文件路径的快捷方式,如何查看实际路径呢?你可以在putty里来到这个位置,应该可以看到这个链接指向的文件的位置,方便你理解我给你贴个图,比如这个文件,他实际的位置是在这个prediction里面,你要是想下载,就去prediction里下载当时让大家move了,所以你的demo里可能是空的,你...
回答于 2024-07-18 15:08
使用图中这条命令时参考序列格式是fasta.gz格式有影响吗，需要转...
文件的编码不是utf-8,你有没有把这个软件用到的文件(那几个fa.gz文件)放到windows环境下编辑? 有的话应该是这个问题,没有的话你可能需要用软件检查一下这几个文件的格式或者说是否损坏,用file,百度查一下简单用法就有
回答于 2024-02-20 15:26
关于TajimaD的筛选问题
主要还是看目的第一个问题,这个看起来你应该是关注的纯化选择把,那就一般是负值第二个问题一般来说将栽培品种除以地方品种的value值后再筛选可能更有意义，因为这反映了相对于地方品种，栽培品种的选择强度变化,但如果你更关注栽培品种自己的选择信号,那就用栽培品种的value值
回答于 2024-02-02 10:15
R语言，KNN补值函数impute.knn函数
> library('impute') > getAnywhere ('knnimp') A single object matching ‘knnimp’ was found It was found in the following places namespace:impute with value function (x, k = 10, maxmiss = 0.5, maxp = 1500) { pn <- dim(x) dn <- dimnames(x) p <- as.integer(pn[1]...
回答于 2023-11-10 15:38
老师，在学习扩增子高级分析群落数据co-occurrence network分析...
这个主要是因为igraph更新以后权重向量不能为负了，而我们代码里的筛选条件筛出来的数据有一个负值，只需要提高一下条件就好了，把数据设置成截图里的就行 换成自己的数据也是一样的，先是用原来的参数跑，如果报了同样的错误，就适当提高参数
回答于 2022-12-12 16:46