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17 个回答

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老师您好,我想请问一下如果我想做植物在干旱胁迫下不同时间点的...

那老师我只是在这个胁迫下的不同时间点取样,然后做的转录组测序,并未涉及到抗旱不抗旱,这样的试验设计有性状数据吗?还是说不同的这些时间点就属于不同的性状呢

回答于 2020-03-09 09:43

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老师您好,我想请问一下,我在做GEO双通道芯片标准化时遇到下面...

老师,用课程里的代码没有报错,但是得到的normarlize_expression.M.csv文件就如我截屏里的所示,肯定是有问题的,但我不知道问题在哪里

回答于 2019-08-26 20:33

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一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这...

老师,实在不好意思,我没太看懂您的这句话,意思是我可以直接用这个值做热图代表我的基因家族成员发生了差异基表达吗

回答于 2019-07-10 10:03

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老师,我想问一下课程里面有个课程是可以处理双通道芯片的,它是...

一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这个文件中我看值应该是去过log2的,我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1,这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据,如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了,我可以直接拿这...

回答于 2019-07-08 21:10

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老师请问一下这种图是怎么做出来的呢?我会做内含子外显子的图,...

那怎么把内含子外显子图和比对的序列像这样组合到一起呢?AI也可以实现吗?想象不来这个如何在AI 中在内含子外显子下面把这种比对形式的序列加上?可以麻烦老师说的详细一点吗?麻烦老师了

回答于 2019-07-05 16:10

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老师您好,我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的serie...

老师您好,对于文件中数值是这样解释的,没看懂这句话的意思,“Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1”

回答于 2019-07-05 16:05

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老师麻烦您看看这是我在GEO数据库里找到的芯片数据,没有看懂样...

老师,具体的我点开也看了,但是还是没有明白这里后缀为KE1,KE2,B1,B2有什么区别

回答于 2019-04-24 17:08

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老师,我在用比较基因组学方法做两个物种之间的共线性分析时,是...

老师,我比对了一下gff文件里的ID和blast文件里的,发现在gff里的有一个ID在blast里是没有的,其他的都是gff里存在的ID,blast文件里都有,这种现象正常吗?难道这是导致共线性结果没有的原因吗?可是这个问题也没法解决了,因为毕竟是输入命令和文件得到的,为什么少了一条呢

回答于 2019-01-05 20:09

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麻烦老师解答一下

老师,不好意思,不知道什么原因,我提问得时候想拍照或是上传图片的,点击了相应的图标,可是总是不成功,才给老师上传了文件形式的,麻烦老师帮我解答一下文件里的问题了,谢谢老师

回答于 2019-01-04 21:21

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老师,我在看菠萝的WRKY基因家族分析时,在看到基因组间共线性分...

可是我不懂文章里面做的共线性分析时红线代表的是哪个物种的WRKY基因,因为看数量肯定不是菠萝的WRKY基因

回答于 2019-01-01 22:35