发起提问 · 2019-10-18 13:23 老师您好,我在作比较基因组学,麻烦您帮我看看这两个文件bed和cds有什么问题吗?因为出现AT3G10920 not in AT.bed这种问题
发起提问 · 2019-10-17 11:17 老师您好,我想问一下在做基因家族成员在植物各个组织器官中的表达量时(qPCR),一般是以哪一个器官为对照呢?是随意选的吗?我看有的文献是以根,有的是以茎的为对照,这是如何确定的呢
发起提问 · 2019-10-15 20:48 老师您好,我在做比较基因组学时遇到下面的问题是什么原因呢,我已经再三确认过AT.bed和 AT.cds文件时能对上ID号的
发起提问 · 2019-10-14 21:48 老师您好,我想请问一下,在做比较基因组学时,在这一步时,/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jivi.compara.catalog ortholog AT ST --cscore=0.7,运行时出现/b
发起提问 · 2019-09-26 20:37 您这里的课程筛选串联重复基因的标准是参照这篇文献的extent of gene duplication in the genomes of Drosophila,nematode ,and yeast(2002). Mol Biol Evol。 这篇文献是
发起提问 · 2019-09-01 21:49 老师您好,请问一下在做双通道芯片标准化时按照课程里的代码,前面都运行的很顺利,但是运行到如下过程就报错,提示Error: object 'SampleNameS' not found,该如何解决呢
发起提问 · 2019-08-21 21:28 老师您好,我想请问一下下面这个热图用R语言绘制(我买的是您这里的“R语言基础绘图这门课”,用的是pheatmap),请问一下color这个参数如何设置才能和这个图的一样呢,因为一般都是设置col=c("blue","white","red"), 其它的像下
发起提问 · 2019-08-20 21:25 老师您好,我想请问一下,我在做GEO双通道芯片标准化时遇到下面这种情况,一直没有报错,而且看起来exprs=exprs.MA(MAList)这一步head了一下也是合适的,但是到averMAList=avereps(MAList,ID=MAList$gen
发起提问 · 2019-08-16 20:36 老师请问一下,在用pheatmap做热图时,scale函数我有点不明白,这个函数可以对横行或者竖行标准化,即分别设置为row或者column,可是这样有个问题就是,如果我做横行标准化的话,就会出现横行某个基因的某个值明明比另一个基因的某个值大,但是颜色上确
发起提问 · 2019-08-13 21:51 老师您好,请问一下这种图是怎么画出来的呢