发起提问 · 2019-04-21 17:02 老师麻烦您看看这是我在GEO数据库里找到的芯片数据,没有看懂样本后缀KE1,KE2,B1,B2代表的是什么意思,按道理来说后缀应该都是rep1,rep2,rep3这样子的重复才对啊,这里的没看懂是什么重复
发起提问 · 2019-03-28 10:54 老师,麻烦您看一下我下载了这种series_matrix.txt 文件后续可以怎么分析,找到我自己一些感兴趣基因的表达量绘制热图,看这个文件像是双通道芯片对吗
发起提问 · 2019-03-21 16:58 老师我想问一下我没有以下这种情况,就是比如说鉴定的马铃薯基因在马铃薯数据库中有,但是在ncbi中没有找到它的序列,这种情况应该怎么做呢,因为要做基因定量的话只有在ncbi中可以看到它的CDS区
发起提问 · 2019-03-20 09:39 老师您好,我想问一下关于双通道芯片转录组数据分析的相关课程和资料有吗?因为我在GEO数据库里找到的我需要的转录组数据是双通道芯片的
发起提问 · 2019-03-16 11:09 老师,我想请问一下下面的这个文件里面的数据可以直接用吗?这是下载自对应植物基因组数据库的,就是一些基因在胁迫处理和各个组织器官中的表达量。其次我想问一下有什么方法可以知道这个文件来自那篇文献,这样我觉得有助于理解。
发起提问 · 2019-03-16 00:17 老师,我想问一下直接从某植物对应的基因组数据库里下载的FPKM文件可以直接用吗?比如说里面有各个基因在各个组织器官上的表达量,我可以直接用里面的数据做热图吗?
发起提问 · 2019-03-15 17:15 老师,我想问一下GEO数据挖掘可以做植物的吗?因为我发现这个都做的是人体疾病的,植物的一般都是去对应植物的基因组数据库里去下载,对吗?
发起提问 · 2019-03-14 16:47 我在文献中读到这么一段话,是关于某一基因家族在某植物各个组织器官中表达的,请老师帮我看看这是怎么做的
发起提问 · 2019-03-14 10:57 基因家族后续实验部分,我看您提到说做转录组绘制热图,再筛选一些基因做qPCR,可是老师您说的转录组就是那个送公司要花一些钱做的那个转录组数据吗?如果是那个会不会成本太高了,我看大部分文献里只做qPCR
发起提问 · 2019-03-13 20:27 我想问一下基因家族分析后续实验添加部分,只做一种胁迫处理,然后做qPCR,看每个基因的表达量,这样补这个实验部分可以发sci吗?因为我发现一般基因家族分析文章至少都会做两种处理然后看基因表达量