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56 个问题
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老师,您这里GEO芯片挖掘的课程是针对单通道芯片还是双通道芯片的呢,还是都有,因为我需要双通道芯片的数据挖掘课程
1/2570
2019-07-09 22:27
一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这个文件中我看值应该是去过log2的,我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1,这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据,如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了,我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗?因为在文献中也没有见过这种情况的作图,希望老师指点一下,谢谢老师
2/4021
2019-07-09 15:36
老师,我想问一下课程里面有个课程是可以处理双通道芯片的,它是具体处理出来是怎么样的呢,是知道了每个处理的表达量吗
2/3580
2019-07-06 09:57
老师请问一下这种图是怎么做出来的呢?我会做内含子外显子的图,也知道图上所得到的ghr-miR的信息,可是我无法把这二者像此图一样结合到一起
2/5812
2019-07-05 15:53
老师您好,我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的series_matrix.txt文件中的数值是有正负求的,并且数值基本没有超过10的,是不是说明这些值已经是处理和对照的比值然后取了log2所得到的呢,如果是的话我是不是可以直接通过观察这个文件里面的值就可以看到我所研究的基因有没有发生上调和下调,然后可以直接用这个值来做我的基因家族成员表达的热图吗
2/3725
2019-07-04 11:34
老师您好,我在做自己研究的物种(物种)中,做基因组内的串联重复和片段复制,结果发现没有任何串联重复和片段复制的基因,这种现象正常吗?我用的是咱们基因家族分析课程里的方法,运行过程应该没有问题,也没有报错
2/4811
2019-05-10 10:30
老师麻烦您看看这是我在GEO数据库里找到的芯片数据,没有看懂样本后缀KE1,KE2,B1,B2代表的是什么意思,按道理来说后缀应该都是rep1,rep2,rep3这样子的重复才对啊,这里的没看懂是什么重复
2/4751
2019-04-21 17:02
老师,麻烦您看一下我下载了这种series_matrix.txt 文件后续可以怎么分析,找到我自己一些感兴趣基因的表达量绘制热图,看这个文件像是双通道芯片对吗
1/4983
2019-03-28 10:54
老师我想问一下我没有以下这种情况,就是比如说鉴定的马铃薯基因在马铃薯数据库中有,但是在ncbi中没有找到它的序列,这种情况应该怎么做呢,因为要做基因定量的话只有在ncbi中可以看到它的CDS区
1/3354
2019-03-21 16:58
老师您好,我想问一下关于双通道芯片转录组数据分析的相关课程和资料有吗?因为我在GEO数据库里找到的我需要的转录组数据是双通道芯片的
1/3364
2019-03-20 09:39
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