2024-12-17 23:42 回答问题

还想补充一个问题，因为我的物种是杨树，已经多个基因组公布，我能不能根据他们来进行同源预测，需要的gff文件是什么样的，因为我在phytozome下载的gff3文件打开跟database中的gff内容不一样，还有就是我计划用毛果杨4.1版本做17.liftoff.sh，想问下应该用下图中哪个gff3文件？还有就是18.PASA.sh中est应该用下图中哪个文件？

2024-12-17 23:15 回答问题

上图是生成的文件，似乎是缺少什么索引或者排序导致的，我的HIC是用的AAGCTT，核实过

2024-12-17 23:11 发起提问

2024-12-12 21:00 发起提问

2024-12-10 10:25 发起提问

2024-12-09 13:17 发起提问

2024-12-05 23:16 发起提问

2024-11-27 17:53 发起提问

2024-01-14 23:12 发起提问

2023-12-01 16:11 回答问题

解决了，要把之前生成的sort.bam文件删除